More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2136 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2136  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 349 aa  694    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1933  MscS Mechanosensitive ion channel  65.6 
 
 		 358 aa  454  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0292  hypothetical protein  56.3 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.40096  hitchhiker  0.00233312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2114  MscS Mechanosensitive ion channel  54.52 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2268  MscS mechanosensitive ion channel  53.8 
 
 		 362 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.528739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2539  MscS Mechanosensitive ion channel  53.35 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.984511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1009  small-conductance mechanosensitive channel  55.75 
 
 		 331 aa  341  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0247  hypothetical protein  49.05 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2855  MscS mechanosensitive ion channel  51.95 
 
 		 374 aa  292  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2160  mechanosensitive ion channel family protein  54.34 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2257  small-conductance mechanosensitive ion channel  53.03 
 
 		 407 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0990371  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1945  MscS Mechanosensitive ion channel  52.65 
 
 		 407 aa  288  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.415325  normal  0.454872 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1419  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2436  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3394  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2314  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1910  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1183  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2275  mechanosensitive ion channel family protein  56.18 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0118  MscS Mechanosensitive ion channel  49.23 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.472344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0785  MscS Mechanosensitive ion channel  51.4 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0017606  normal  0.0299135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1911  MscS mechanosensitive ion channel  53.1 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6191  MscS mechanosensitive ion channel  53.1 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.593763  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1888  MscS mechanosensitive ion channel  53.1 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4345  MscS mechanosensitive ion channel  48.65 
 
 		 361 aa  281  9e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1241  mechanosensitive ion channel family protein  51.94 
 
 		 362 aa  281  9e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1797  MscS mechanosensitive ion channel  52.71 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.986921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5044  mechanosensitive ion channel protein  47.71 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5188  MscS mechanosensitive ion channel  51.94 
 
 		 390 aa  279  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2062  MscS mechanosensitive ion channel  47.37 
 
 		 352 aa  278  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1386  MscS mechanosensitive ion channel  52.33 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3905  MscS mechanosensitive ion channel  47.44 
 
 		 373 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0415  small-conductance mechanosensitive channel  46.69 
 
 		 371 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.344204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1825  MscS mechanosensitive ion channel  52.33 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0903923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02550  membrane protein  52.12 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3749  Small-conductance mechanosensitive ion channel  50.19 
 
 		 380 aa  275  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3972  MscS Mechanosensitive ion channel  43.67 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0682489  normal  0.528998 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3568  MscS Mechanosensitive ion channel  48.65 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.492229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  45.93 
 
 		 359 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2275  MscS mechanosensitive ion channel  50.58 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.312032  normal  0.0129381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1121  MscS mechanosensitive ion channel  49.04 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3654  MscS mechanosensitive ion channel  49.23 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3940  MscS Mechanosensitive ion channel  48.85 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3947  MscS Mechanosensitive ion channel  49.23 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0285178  normal  0.460909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0235  MscS mechanosensitive ion channel  47.72 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0636  MscS mechanosensitive ion channel  51.5 
 
 		 364 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33880  small-conductance mechanosensitive channel  50.77 
 
 		 727 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415466  normal  0.49587 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3703  MscS mechanosensitive ion channel  46.43 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0936689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0914  MscS mechanosensitive ion channel  40.98 
 
 		 411 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5934  MscS Mechanosensitive ion channel  43.46 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0838  MscS Mechanosensitive ion channel  42.16 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1046  MscS mechanosensitive ion channel  42.81 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6267  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  50.93 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3570  MscS mechanosensitive ion channel  47.11 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0017  MscS Mechanosensitive ion channel  43.62 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.305748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0178  MscS mechanosensitive ion channel  46.09 
 
 		 545 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.760917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6211  MscS Mechanosensitive ion channel  51.15 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2263  MscS mechanosensitive ion channel  43.07 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2302  MscS mechanosensitive ion channel  43.07 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.47196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2310  MscS mechanosensitive ion channel  43.07 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6897  MscS mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 492 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1758  MscS mechanosensitive ion channel  45.38 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2022  small-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5784  MscS mechanosensitive ion channel  45.28 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1771  MscS mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 400 aa  215  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2161  MscS Mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.307461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3015  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1861  MscS Mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 402 aa  205  9e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1203  MscS Mechanosensitive ion channel  47.62 
 
 		 372 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.950573  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10518  MscS Mechanosensitive ion channel  35.97 
 
 		 591 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.526339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1004  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 648 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1262  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 627 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.523793  normal  0.0747451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0783  MscS mechanosensitive ion channel  27.31 
 
 		 571 aa  115  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  28.77 
 
 		 566 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 268 aa  97.8  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5898  MscS Mechanosensitive ion channel  34.62 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  31.93 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1010  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.926579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 467 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  23.55 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  24.63 
 
 		 633 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  22.97 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  33.8 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 533 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  25.25 
 
 		 806 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 637 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  31.06 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  25.82 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10253  hypothetical protein  26.81 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00229932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 550 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 547 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3168  MscS Mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0116515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>