More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0809 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  100 
 
 		 592 aa  1197    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  56.54 
 
 		 313 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  55.05 
 
 		 312 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  35.88 
 
 		 689 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  47.52 
 
 		 314 aa  292  1e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  48.51 
 
 		 314 aa  290  6e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  34.69 
 
 		 621 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  47.19 
 
 		 314 aa  286  7e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  46.53 
 
 		 314 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  33.62 
 
 		 614 aa  277  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  31.8 
 
 		 606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  32.83 
 
 		 624 aa  274  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  44.77 
 
 		 311 aa  273  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  46.71 
 
 		 306 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  35.12 
 
 		 629 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  32.11 
 
 		 640 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  31.16 
 
 		 626 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  33.28 
 
 		 630 aa  263  6e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  44.95 
 
 		 313 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  44.77 
 
 		 321 aa  260  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  46.37 
 
 		 327 aa  258  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  42.76 
 
 		 317 aa  256  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  47.59 
 
 		 313 aa  255  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  46.64 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  45.21 
 
 		 327 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  46.36 
 
 		 305 aa  254  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  44.16 
 
 		 315 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  44.98 
 
 		 327 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  43.18 
 
 		 310 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  46.58 
 
 		 327 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  33.01 
 
 		 624 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  42.86 
 
 		 310 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  44.55 
 
 		 314 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  44.55 
 
 		 314 aa  253  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  44.55 
 
 		 326 aa  252  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  32.25 
 
 		 627 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  30.57 
 
 		 618 aa  251  2e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  45.55 
 
 		 327 aa  251  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  47.6 
 
 		 314 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  43.52 
 
 		 312 aa  249  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  45.42 
 
 		 322 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  45.1 
 
 		 310 aa  247  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  43.69 
 
 		 326 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  41.45 
 
 		 319 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  31.71 
 
 		 636 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  47.71 
 
 		 308 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  44.95 
 
 		 313 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  47.73 
 
 		 311 aa  238  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  40.27 
 
 		 317 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  44.81 
 
 		 311 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  40.13 
 
 		 320 aa  236  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  32.03 
 
 		 639 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  44.85 
 
 		 325 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  43.34 
 
 		 311 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  47.02 
 
 		 313 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  39.87 
 
 		 317 aa  233  8.000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  46.95 
 
 		 273 aa  233  9e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  30.94 
 
 		 612 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  38.82 
 
 		 318 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  39.46 
 
 		 320 aa  232  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  40.45 
 
 		 314 aa  230  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  46.49 
 
 		 318 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  46.58 
 
 		 314 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  42.19 
 
 		 311 aa  229  1e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  43.46 
 
 		 315 aa  227  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  40.13 
 
 		 317 aa  227  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  28.39 
 
 		 623 aa  223  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  40.72 
 
 		 312 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  39.94 
 
 		 324 aa  221  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  39.93 
 
 		 342 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  30.95 
 
 		 653 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  40.58 
 
 		 312 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  40.45 
 
 		 317 aa  217  5.9999999999999996e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  42.26 
 
 		 319 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4532  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.87 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4395  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.87 
 
 		 635 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  44 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  39.94 
 
 		 312 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  44.52 
 
 		 319 aa  214  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4569  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.49 
 
 		 635 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  39.94 
 
 		 312 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0471  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.47 
 
 		 636 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0484  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  31.47 
 
 		 636 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0190528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  30.16 
 
 		 648 aa  212  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  29.12 
 
 		 635 aa  211  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  29.12 
 
 		 635 aa  211  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  44.49 
 
 		 274 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  44.57 
 
 		 336 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  38.19 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  43.37 
 
 		 308 aa  207  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  38.49 
 
 		 322 aa  206  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0828  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.12 
 
 		 627 aa  206  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08521  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  30.5 
 
 		 643 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.68369  hitchhiker  0.000952628 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0300  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.08 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.533137  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2109  transketolase domain-containing protein  46.64 
 
 		 268 aa  206  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.337076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09721  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  28.91 
 
 		 628 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.274515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  37.34 
 
 		 314 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  45.45 
 
 		 267 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  37.7 
 
 		 313 aa  204  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1511  1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase  29.88 
 
 		 640 aa  203  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>