More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5189 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5189  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 981 aa  1947    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2243  TonB-dependent receptor  38.66 
 
 		 1000 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  34.84 
 
 		 1020 aa  449  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4602  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 875 aa  359  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.683128  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2859  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 902 aa  349  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115194  normal  0.0892472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2047  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 803 aa  347  6e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 869 aa  266  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 874 aa  253  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 852 aa  245  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 869 aa  237  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 861 aa  237  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1520  TonB-dependent receptor  24.98 
 
 		 1055 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 861 aa  234  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 861 aa  232  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 855 aa  227  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 847 aa  226  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3032  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 874 aa  225  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.793097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 871 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37730  putative TonB dependent receptor  29.08 
 
 		 880 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.951701  normal  0.164066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 875 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 950 aa  222  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 861 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 861 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 861 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0708  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 956 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.888049  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 897 aa  215  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 901 aa  212  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  28.05 
 
 		 877 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 857 aa  210  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0477  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 879 aa  208  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 904 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 930 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 930 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 930 aa  207  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 910 aa  206  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 935 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3740  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 901 aa  202  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 944 aa  202  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 981 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 873 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 873 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 890 aa  199  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 890 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 974 aa  197  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 883 aa  195  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 890 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 933 aa  193  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  26.41 
 
 		 884 aa  192  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 937 aa  192  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 883 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 883 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00638  iron transport protein  26.53 
 
 		 827 aa  189  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 985 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2600  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 856 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  25.22 
 
 		 936 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 975 aa  185  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0703  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 954 aa  183  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0917927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1691  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 894 aa  183  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 966 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 924 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  26.84 
 
 		 914 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2699  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 886 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.475317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2263  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 882 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.594677  normal  0.894337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2624  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 886 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0750923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2335  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 882 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0682535  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.72 
 
 		 853 aa  175  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 853 aa  174  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1117  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 939 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2531  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 843 aa  170  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 838 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.17 
 
 		 839 aa  168  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2904  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 914 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 841 aa  168  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01753  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 901 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.421207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 876 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2393  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 866 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.228025  normal  0.562058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3922  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 948 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.719329  normal  0.0833572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 987 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 836 aa  166  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 907 aa  163  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 907 aa  164  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 981 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2291  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 922 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152669  normal  0.0285161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 924 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 855 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 855 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 842 aa  161  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 		 853 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 853 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 853 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0991  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 925 aa  158  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2872  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 982 aa  157  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1499  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 894 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0739  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 912 aa  155  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0580341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1970  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 976 aa  154  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>