141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7721 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7721  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 462 aa  913    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  39.74 
 
 		 445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  36.07 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.56 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7201  extracellular solute-binding protein family 1  35.88 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0234  extracellular solute-binding protein family 1  32.22 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.497123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 		 435 aa  116  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1045  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 488 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0733801  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.81 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.82 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 425 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.9 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.12 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  34.36 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0494  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.19 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 417 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  28.28 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.79 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 425 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.33 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 426 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  31.97 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.47 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.72 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.19 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 420 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 412 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2093  glycerol-3-phosphate ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.6 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107678  normal  0.487826 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.21 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  27.12 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>