156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6844 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 
1468 aa  2942    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.39 
 
 
1050 aa  215  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  30.29 
 
 
1488 aa  194  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  31.24 
 
 
1056 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.89 
 
 
1039 aa  174  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.04 
 
 
1262 aa  163  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.37 
 
 
1068 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
1185 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
1128 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  21.25 
 
 
1040 aa  155  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.09 
 
 
1328 aa  155  8e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 
1288 aa  152  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.77 
 
 
1186 aa  151  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.55 
 
 
1424 aa  147  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
924 aa  141  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.07 
 
 
1324 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
1105 aa  139  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
1215 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.11 
 
 
885 aa  135  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  28.97 
 
 
1000 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
837 aa  129  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
771 aa  128  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.09 
 
 
1507 aa  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.3 
 
 
787 aa  127  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
1283 aa  126  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
454 aa  125  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  32.04 
 
 
963 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  28.37 
 
 
900 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  26.12 
 
 
849 aa  124  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.45 
 
 
767 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.5 
 
 
1500 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270488 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  25.19 
 
 
1131 aa  122  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  18.66 
 
 
2145 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  22.83 
 
 
828 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
911 aa  119  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  25.58 
 
 
845 aa  118  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 
1125 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  27.31 
 
 
992 aa  116  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.14 
 
 
897 aa  115  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  25 
 
 
1309 aa  114  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  25.15 
 
 
1523 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.82 
 
 
801 aa  111  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  25.95 
 
 
838 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
776 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 
991 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  24.66 
 
 
843 aa  109  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  29.39 
 
 
859 aa  108  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 
899 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  24.69 
 
 
1383 aa  107  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 
1290 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  26.2 
 
 
934 aa  102  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.09 
 
 
822 aa  101  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 
814 aa  100  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.59 
 
 
725 aa  99.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  24.58 
 
 
1314 aa  99.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
843 aa  99  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  23.26 
 
 
1475 aa  97.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  26.83 
 
 
675 aa  96.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
568 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
568 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.47 
 
 
1404 aa  95.1  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.23 
 
 
841 aa  94  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 
443 aa  93.6  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.46 
 
 
672 aa  92.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
1088 aa  92  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 
953 aa  90.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.14 
 
 
713 aa  88.6  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
785 aa  87.8  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25 
 
 
1146 aa  87.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.33 
 
 
825 aa  87  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 
751 aa  85.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
284 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  22.29 
 
 
919 aa  83.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
949 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
857 aa  79.7  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 
1311 aa  79.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 
919 aa  79  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.75 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  28.96 
 
 
457 aa  77.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.41 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  24.05 
 
 
708 aa  75.5  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  30.25 
 
 
702 aa  75.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  19.96 
 
 
1550 aa  75.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
577 aa  75.1  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.78 
 
 
1136 aa  74.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0961  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.81 
 
 
911 aa  74.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  20.6 
 
 
740 aa  75.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
481 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.46 
 
 
799 aa  73.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.93 
 
 
1106 aa  72.4  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  20.95 
 
 
1212 aa  72.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.55 
 
 
732 aa  72  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.16 
 
 
977 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  30.59 
 
 
847 aa  70.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.05 
 
 
829 aa  70.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.83 
 
 
1228 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  25.71 
 
 
1509 aa  70.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247222 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>