100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6825 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  100 
 
 
297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  59.52 
 
 
308 aa  358  7e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  60.41 
 
 
297 aa  350  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  60.75 
 
 
297 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  60.07 
 
 
884 aa  349  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  59.72 
 
 
333 aa  347  1e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  62.28 
 
 
285 aa  345  5e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  60.14 
 
 
311 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  54.45 
 
 
301 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  54.03 
 
 
308 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  52.23 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  53.87 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  50.34 
 
 
309 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.01 
 
 
289 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  34.88 
 
 
300 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  28.17 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  32.62 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  28.17 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  27.82 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  27.82 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  27.82 
 
 
385 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  36.67 
 
 
277 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  26.63 
 
 
295 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  22.13 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  24 
 
 
294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  26.7 
 
 
289 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
293 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  26.11 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  26.4 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  26.01 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2856  amidohydrolase 2  31.41 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.156395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  30.86 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  24.46 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  26.36 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  26.49 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43860  Amidohydrolase  28.67 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106274  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  30.13 
 
 
287 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  28.02 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  27.68 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  28.66 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  30.77 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  25.46 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
308 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
275 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2868  amidohydrolase 2  24.43 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.341603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  26.12 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.29 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0404  amidohydrolase 2  29.29 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.826909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  22.41 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  26.83 
 
 
280 aa  49.7  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  25.71 
 
 
289 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  24.69 
 
 
368 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.23 
 
 
273 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4198  amidohydrolase 2  22.48 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200057  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  32.76 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  43.75 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  24.1 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2538  putative amidohydrolase  31.15 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0561  amidohydrolase 2  27.33 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  28.21 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  28.21 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  25.4 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  29.66 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  25.57 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0928  hypothetical protein  26.03 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4940  amidohydrolase 2  30.91 
 
 
305 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207078  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  32.45 
 
 
279 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  21.71 
 
 
218 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
293 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  28.85 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7142  amidohydrolase 2  27.15 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112439  normal  0.443882 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  30.95 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  25.71 
 
 
300 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0303  amidohydrolase 2  25.91 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2061  amidohydrolase 2  25.35 
 
 
331 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.523278  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  24.66 
 
 
286 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1069  amidohydrolase 2  23.04 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0286  amidohydrolase 2  25.13 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0918  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146298  normal  0.0660058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  28.44 
 
 
392 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5104  amidohydrolase 2  24.2 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361285  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  24.35 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  24.84 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  27.82 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  26.72 
 
 
261 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  25.42 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>