More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2492 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 322 aa  630  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  51.52 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  49.08 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  49.23 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  49.85 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 214 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  39.61 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 317 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  32.83 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4447  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000015359  hitchhiker  0.00108803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8683  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1362  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00431533  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 325 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  33.54 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  32.53 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 324 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  30.18 
 
 		 327 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2108  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.472449  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.18 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3848  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0846255  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  36.83 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8401  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1077  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  32.01 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2564  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 309 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1077  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 320 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  29.81 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0903  transcriptional regulator, AraC family  33.43 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3559  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 323 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  35.45 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5115  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0388343  normal  0.0650522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 359 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3961  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0742642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  27.91 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3471  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2858  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.13 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.113519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  33.78 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 		 315 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2404  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.84 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6761  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.844239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  31.33 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  31.87 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2982  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  hitchhiker  0.00381419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.33 
 
 		 292 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0868  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.670337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1532  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  0.737753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>