More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1590 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  58.2 
 
 		 187 aa  207  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  58.2 
 
 		 187 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 187 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  57.51 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  58.03 
 
 		 187 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 		 187 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  56.99 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  50.99 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  52.91 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 187 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  51.35 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  50.28 
 
 		 188 aa  170  9e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  52.75 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  49.49 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  47.09 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  46.56 
 
 		 200 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  46.56 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  51.08 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  51.08 
 
 		 199 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  49.46 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  46.35 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  48.89 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  48.33 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  48.33 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  46.11 
 
 		 188 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  46.11 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  43.98 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  46.96 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 		 189 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  41.8 
 
 		 200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  36.52 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 213 aa  87  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  35.45 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  34.62 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.76 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.48 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.66 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  35.38 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.11 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  31.79 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  30.06 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.79 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  37.5 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  33.52 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.29 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.88 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  28.19 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  32.11 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  32.29 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  30.16 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.44 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  32.11 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7270  isochorismatase hydrolase  29.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0591041  normal  0.365805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  31.91 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  32.11 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.29 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  29 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  31.02 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  30.89 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.43 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6128  isochorismatase hydrolase  34.39 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  31.77 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>