128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2703 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  817    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  37.73 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  34.04 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  32.64 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 395 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 395 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  33.22 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.33 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  27.49 
 
 		 399 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  22 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  26.84 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 878 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.84 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  27.04 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1038  putative cytochromre c biogenesis protein  27.41 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.944461  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 		 263 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 718 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 245 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 534 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 3035 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2632  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.4 
 
 		 1385 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2363  hypothetical protein  30.56 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000181348  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.11 
 
 		 573 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 1121 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.13 
 
 		 695 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 750 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  32.48 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 649 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  30.61 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 632 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.56 
 
 		 878 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.94 
 
 		 1154 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  24.85 
 
 		 566 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2246  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 252 aa  47.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353905 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  32.91 
 
 		 336 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 934 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 884 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 2262 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 		 645 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1014  TPR domain-containing protein  30.65 
 
 		 670 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.8 
 
 		 647 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 711 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.18 
 
 		 733 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 2262 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.84 
 
 		 576 aa  46.6  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.56 
 
 		 820 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.16 
 
 		 248 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.29 
 
 		 1694 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 351 aa  46.6  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3364  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 234 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 722 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  31.82 
 
 		 1044 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.38 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3510  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.429554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 824 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3446  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  31.31 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.67 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 771 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.84 
 
 		 1186 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 740 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  26.45 
 
 		 622 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28.19 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.97 
 
 		 462 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 632 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 646 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 885 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1039 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 		 1067 aa  44.3  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 3145 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 161 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4902  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 737 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 2240 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>