More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2799 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2800  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  64.68 
 
 
696 aa  887    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0120614  normal  0.163305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2799  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  100 
 
 
716 aa  1455    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000869  normal  0.160664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  44.32 
 
 
724 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  42.37 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  39.08 
 
 
715 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  36.3 
 
 
726 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  34.54 
 
 
708 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  37.19 
 
 
730 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.67 
 
 
802 aa  173  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.1 
 
 
795 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1456  diguanylate cyclase  28.22 
 
 
636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
662 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2109  diguanylate cyclase  28.95 
 
 
630 aa  160  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.843932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4835  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
662 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203793  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0529  diguanylate cyclase  26.56 
 
 
614 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 
663 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1654  chromosome segregation ATPase; intracellular signalling protein  27.14 
 
 
596 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.353113  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 
782 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.33 
 
 
1780 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5597  Diverse 7TM receptor transmembrane region  28.6 
 
 
634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  24.59 
 
 
612 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  27.72 
 
 
565 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1906  response regulator receiver domain-containing protein  26.92 
 
 
603 aa  146  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2730  diguanylate cyclase  25.74 
 
 
638 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.814579  normal  0.595433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  24.88 
 
 
668 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3587  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.58 
 
 
642 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.361331  hitchhiker  0.0015887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
644 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00181069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.54 
 
 
914 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  29.47 
 
 
1811 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3844  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.8 
 
 
867 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.25 
 
 
1901 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  25.94 
 
 
588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0469  diguanylate cyclase  27.35 
 
 
601 aa  132  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912167  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  24.22 
 
 
677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
589 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0992  two-component sensor histidine kinase  24.38 
 
 
696 aa  130  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0439814  normal  0.153335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.07 
 
 
1808 aa  130  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  31.69 
 
 
770 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2871  response regulator  26.77 
 
 
564 aa  128  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
585 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4358  Diverse 7TM receptor transmembrane region  25.2 
 
 
600 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.934126  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1301  diguanylate cyclase  27.3 
 
 
561 aa  126  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
611 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
611 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4207  GGDEF domain-containing protein  27.88 
 
 
625 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
1123 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
468 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
439 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  29.97 
 
 
1850 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.18 
 
 
749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0141753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3589  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.34 
 
 
853 aa  122  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  26.89 
 
 
611 aa  122  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  21.8 
 
 
918 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
678 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1782  diguanylate cyclase  25 
 
 
629 aa  121  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.63 
 
 
1804 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2267  hypothetical protein  25.46 
 
 
590 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.22249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  21.54 
 
 
918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
407 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  28.45 
 
 
358 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
594 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
971 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
537 aa  118  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
688 aa  117  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
390 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
594 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  25.16 
 
 
611 aa  117  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1596  Diverse 7TM receptor transmembrane region  23.68 
 
 
660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0651  diguanylate cyclase  28.48 
 
 
627 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.605256  hitchhiker  0.0000117316 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4218  diguanylate cyclase  25.11 
 
 
631 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  28.18 
 
 
631 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  21 
 
 
914 aa  115  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4433  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
680 aa  115  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
785 aa  115  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6429  response regulator receiver protein  21.06 
 
 
553 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0055  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
591 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.291296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  28.43 
 
 
457 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  26.28 
 
 
445 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  26.02 
 
 
785 aa  114  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  26.28 
 
 
433 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
494 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  31.66 
 
 
2017 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  28.57 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
919 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  28.57 
 
 
358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
1021 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
470 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1222  signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 
650 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.495402  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
389 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  22.91 
 
 
634 aa  111  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
1072 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
553 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
675 aa  110  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>