92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0419 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  100 
 
 		 143 aa  291  1e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  40.2 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  40 
 
 		 230 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  39 
 
 		 668 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.16 
 
 		 804 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  33.33 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  38.38 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  35.05 
 
 		 288 aa  80.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  31.86 
 
 		 506 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  34.02 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  33.66 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  35.2 
 
 		 379 aa  78.2  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  31.03 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  32.48 
 
 		 275 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  36.72 
 
 		 447 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  32.99 
 
 		 274 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  32.65 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.43 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  31.09 
 
 		 413 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  34.31 
 
 		 438 aa  71.2  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  35.42 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  26.67 
 
 		 472 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.15 
 
 		 604 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  31.82 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  33.33 
 
 		 485 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  27.14 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  33.33 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  33.7 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  36 
 
 		 238 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  30.53 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  30.1 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  30.43 
 
 		 269 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  26.85 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.17 
 
 		 280 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  27.03 
 
 		 446 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  33.72 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  30.43 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.05 
 
 		 275 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  27.69 
 
 		 583 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  29.87 
 
 		 285 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  26.92 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  34.57 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  27.59 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  27.74 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.32 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  38.89 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  30.86 
 
 		 250 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  31.31 
 
 		 336 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  33.33 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  27.62 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  27.62 
 
 		 248 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.87 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  29.79 
 
 		 244 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  25.3 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  32.91 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  33.75 
 
 		 287 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  24.76 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  32.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  31.65 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  26.32 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.92 
 
 		 249 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  30 
 
 		 190 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  28.26 
 
 		 256 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  32.5 
 
 		 268 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1509  TonB family protein  23.08 
 
 		 244 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00129543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  30.77 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 		 246 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.44 
 
 		 368 aa  41.6  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1604  TonB family protein  22.22 
 
 		 243 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013758  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 		 246 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 		 248 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 		 246 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3878  TonB-like protein  27.27 
 
 		 261 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.781736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  31.17 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  31.17 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  24.81 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  33.73 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  32.5 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  30.12 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  22.92 
 
 		 245 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  28.72 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  25.61 
 
 		 243 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  25.61 
 
 		 243 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  28.79 
 
 		 239 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  33.77 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  27.13 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  27.16 
 
 		 219 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>