More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1191 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  100 
 
 
404 aa  822    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1987  Dyp-type peroxidase  49.63 
 
 
403 aa  395  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0459  putative Signal recognition particle protein (Fifty-four-like protein)  49.88 
 
 
403 aa  397  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  39.95 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0654  peptidoglycan-binding LysM:Lytic transglycosylase, catalytic (SLT family)  44.85 
 
 
383 aa  310  4e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0645436  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0748  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  43.7 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0673  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  43.42 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1354  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  43.7 
 
 
372 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1082  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 
379 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  35.08 
 
 
506 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  33.43 
 
 
499 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 
620 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31.54 
 
 
499 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  32.96 
 
 
498 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  33.51 
 
 
487 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.12 
 
 
572 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
544 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  32.53 
 
 
507 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  32.45 
 
 
484 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  29.01 
 
 
573 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0300  regulatory protein dnir  36.39 
 
 
321 aa  173  5e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.89505  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  28.77 
 
 
573 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30 
 
 
617 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  32.11 
 
 
547 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  33.66 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 
544 aa  163  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  29.68 
 
 
638 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.71 
 
 
457 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  30.23 
 
 
587 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.5 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.47 
 
 
530 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  27.67 
 
 
442 aa  150  4e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  28.68 
 
 
534 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1895  Lytic transglycosylase catalytic  29.52 
 
 
693 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.42 
 
 
464 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.97 
 
 
406 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  29.97 
 
 
452 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  26.23 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.97 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  27.65 
 
 
618 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  26.23 
 
 
476 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.1 
 
 
554 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  26.9 
 
 
448 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  28.86 
 
 
501 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.23 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.23 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.23 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  29.74 
 
 
524 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.23 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.23 
 
 
455 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  27.37 
 
 
518 aa  135  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  25.93 
 
 
473 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 
552 aa  132  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  29.47 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  26.13 
 
 
511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.51 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  25.9 
 
 
595 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  27.75 
 
 
527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 
529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.8 
 
 
395 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  28.27 
 
 
525 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.8 
 
 
472 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 
447 aa  131  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  29.82 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  28.77 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  25.7 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  28.13 
 
 
553 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  30.26 
 
 
529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  29.37 
 
 
525 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  28.23 
 
 
564 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  25.14 
 
 
556 aa  129  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  28.27 
 
 
525 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  27.47 
 
 
523 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  26.89 
 
 
498 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.96 
 
 
564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  24.88 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  29.53 
 
 
511 aa  126  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  27.3 
 
 
539 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  26.47 
 
 
516 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  26.68 
 
 
561 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  26.47 
 
 
516 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  27.32 
 
 
596 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  28.12 
 
 
495 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  26.02 
 
 
661 aa  124  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  27.64 
 
 
523 aa  123  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.03 
 
 
515 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  25.94 
 
 
561 aa  122  8e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  25.12 
 
 
492 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  27.39 
 
 
570 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1516  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase-like lipoprotein  27.61 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.892802  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  27.13 
 
 
552 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  25.55 
 
 
498 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  27.13 
 
 
530 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  25.82 
 
 
570 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>