240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1652 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1652  ipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 347 aa  707    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000716832  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1576  ipid-A-disaccharide synthase  80.35 
 
 		 344 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.426567  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0326  ipid-A-disaccharide synthase  66.76 
 
 		 343 aa  464  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1311  ipid-A-disaccharide synthase  62.39 
 
 		 344 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1683  ipid-A-disaccharide synthase  54.7 
 
 		 364 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0568935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1373  ipid-A-disaccharide synthase  55.8 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0314  ipid-A-disaccharide synthase  54.42 
 
 		 364 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0200  lipid-A-disaccharide synthase  57.89 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0188024  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0336  ipid-A-disaccharide synthase  54.7 
 
 		 364 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0903  ipid-A-disaccharide synthase  48.99 
 
 		 348 aa  334  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  31.88 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  31.52 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  31.9 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  32.7 
 
 		 402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0104  lipid-A-disaccharide synthase  34.98 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000837929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 392 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.99 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  33.22 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  31.71 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.99 
 
 		 388 aa  143  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  31.05 
 
 		 379 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.27 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  30.75 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.3 
 
 		 378 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  30.79 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.23 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  33.55 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  30.47 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  31.36 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.21 
 
 		 384 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  29.74 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  34.27 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  30.65 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.06 
 
 		 396 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  30.89 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  31.75 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2041  lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.819903  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  30.72 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  28 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  30.5 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  28.84 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  30.13 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  33.45 
 
 		 386 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  31.13 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  31.13 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  29.55 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  34.03 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  34.16 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  34.16 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2448  lipid-A-disaccharide synthase  29.75 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.753497  hitchhiker  0.000620569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1286  lipid-A-disaccharide synthase  31.61 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  29.28 
 
 		 386 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.82 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  29.79 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1149  lipid-A-disaccharide synthase  31.21 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1846  lipid-A-disaccharide synthase  35.03 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.309879  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1107  lipid-A-disaccharide synthase  31.21 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  27.1 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  29.1 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1438  lipid-A-disaccharide synthase  29.41 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.14396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  30.48 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  30.4 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3255  lipid-A-disaccharide synthase  31.08 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1374  lipid-A-disaccharide synthase  28.82 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.698361  normal  0.0541377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  28.71 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  29.87 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  30.75 
 
 		 370 aa  126  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  28.25 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  27.96 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  31.65 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2716  lipid-A-disaccharide synthase  28.98 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1788  lipid-A-disaccharide synthase  32.54 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879744  normal  0.0112942 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  30.6 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.63 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  30.7 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1314  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3269  lipid-A-disaccharide synthase  31.15 
 
 		 388 aa  123  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000644789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  30.59 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2682  lipid-A-disaccharide synthase  32.93 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05531  lipid-A-disaccharide synthase  29.63 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2479  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.40409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  30.54 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1542  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  28.74 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  30.32 
 
 		 388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  29.71 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  27.32 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2042  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.119414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2423  lipid-A-disaccharide synthase  30.82 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000133104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1393  lipid-A-disaccharide synthase  30.81 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  28.33 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>