More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0632 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0632  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0334632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3315  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.024617  hitchhiker  0.00000399067 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3661  AraC family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.17 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 537 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0702  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.737092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  33.75 
 
 		 529 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  26.56 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  30.6 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  31.05 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 133 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0543  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 112 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  30.63 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0588  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  32.5 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.41 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2468  transcriptional regulator, AraC family  25.11 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  22.78 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1550  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0774112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.61 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5929  two component AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6198  two component AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  29.52 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2111  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0317919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  25.7 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4108  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405906 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  30.72 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.76 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  21.97 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  32.14 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  34.57 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  28.8 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5518  response regulator receiver protein  29.34 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.484795  normal  0.95745 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.97 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  22.42 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  22.42 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4319  transcriptional regulator, AraC family  21.3 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414094  normal  0.0857311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.74 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>