More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1422 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  77.09 
 
 
413 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  75.52 
 
 
430 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  76.72 
 
 
409 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  83.9 
 
 
411 aa  707    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  76.77 
 
 
411 aa  636    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  74.45 
 
 
407 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
423 aa  868    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  75.41 
 
 
424 aa  640    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  80.93 
 
 
409 aa  683    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  75.41 
 
 
429 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  74.88 
 
 
410 aa  633  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.42 
 
 
409 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  56.58 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55.25 
 
 
419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55 
 
 
419 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  55 
 
 
419 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  51.32 
 
 
422 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  52.03 
 
 
422 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  51.82 
 
 
422 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  53.5 
 
 
424 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  50.71 
 
 
424 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  52.33 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.49 
 
 
423 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  52.25 
 
 
424 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1106  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  81.42 
 
 
184 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802488  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.09 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 
398 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.57 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.91 
 
 
399 aa  143  7e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.5 
 
 
442 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.25 
 
 
410 aa  139  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.31 
 
 
431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.13 
 
 
435 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.22 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.91 
 
 
433 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 
423 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.37 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.4 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.65 
 
 
387 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.67 
 
 
424 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 
433 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 
432 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 
432 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  28.54 
 
 
446 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.81 
 
 
389 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  24.28 
 
 
432 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.28 
 
 
388 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30.22 
 
 
411 aa  106  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.82 
 
 
400 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.45 
 
 
400 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 
433 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.77 
 
 
389 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  28.8 
 
 
389 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.81 
 
 
422 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.3 
 
 
396 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 
412 aa  100  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 
416 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
389 aa  100  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  28.15 
 
 
380 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  28.18 
 
 
420 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  25.3 
 
 
396 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.5 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  28.32 
 
 
399 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.87 
 
 
366 aa  96.7  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.45 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  26.57 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.85 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  28.85 
 
 
373 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  30.32 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.22 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 
404 aa  94  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.21 
 
 
379 aa  94  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.92 
 
 
384 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  24.76 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1031  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.33 
 
 
396 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0972  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.16 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.35 
 
 
395 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.71 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.07 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.83 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.89 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  27.3 
 
 
404 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  24.59 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3480  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.12 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.17 
 
 
413 aa  92  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.11 
 
 
374 aa  92  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.55 
 
 
437 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  28.95 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 
387 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0549352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>