More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7246 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  100 
 
 		 672 aa  1397    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 641 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 605 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 655 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  25.34 
 
 		 755 aa  124  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  25.16 
 
 		 616 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  23.05 
 
 		 770 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 596 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  26.88 
 
 		 506 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 618 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  27.75 
 
 		 550 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  28.71 
 
 		 577 aa  104  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  28.37 
 
 		 603 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  25.43 
 
 		 538 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  26.63 
 
 		 594 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.03 
 
 		 562 aa  102  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  24.05 
 
 		 503 aa  101  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  30.19 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  25 
 
 		 543 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 599 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  28.57 
 
 		 599 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  28.07 
 
 		 599 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  28.65 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  30.87 
 
 		 461 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  25.36 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  29.46 
 
 		 621 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  27.69 
 
 		 498 aa  99  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  26.46 
 
 		 510 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  23.85 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  23.85 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 371 aa  99  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  23.85 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  27.49 
 
 		 544 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  28.98 
 
 		 541 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  25.15 
 
 		 574 aa  97.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.49 
 
 		 577 aa  97.4  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  30.35 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  25.58 
 
 		 591 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  30.2 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  30.2 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  25.98 
 
 		 564 aa  96.3  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  23.52 
 
 		 586 aa  96.3  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  28.75 
 
 		 558 aa  96.3  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  28.72 
 
 		 461 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.63 
 
 		 571 aa  95.5  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  29.71 
 
 		 557 aa  95.1  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  24.11 
 
 		 586 aa  94.7  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  26.34 
 
 		 498 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  25.15 
 
 		 574 aa  94.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  24.64 
 
 		 513 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  24.95 
 
 		 392 aa  94.4  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  25.24 
 
 		 544 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  23.43 
 
 		 586 aa  94.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  26.24 
 
 		 536 aa  94  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  24.54 
 
 		 586 aa  94  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  27.85 
 
 		 563 aa  94  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  26.24 
 
 		 536 aa  94  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  26.24 
 
 		 536 aa  94  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  25.83 
 
 		 577 aa  94  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  26.24 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 579 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.49 
 
 		 577 aa  93.6  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  26.24 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  26.24 
 
 		 536 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 577 aa  92.8  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 560 aa  92.8  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  27.97 
 
 		 570 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 546 aa  93.2  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  24.11 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.87 
 
 		 570 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 557 aa  92  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  26.05 
 
 		 612 aa  92  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 550 aa  92  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  30.42 
 
 		 417 aa  92.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.37 
 
 		 571 aa  92  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  26.11 
 
 		 563 aa  92  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  26.98 
 
 		 553 aa  91.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.24 
 
 		 568 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  23.17 
 
 		 587 aa  91.7  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 577 aa  92  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  32.27 
 
 		 577 aa  91.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 605 aa  91.7  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 670 aa  91.3  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 676 aa  91.3  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  25.78 
 
 		 502 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  30.23 
 
 		 563 aa  90.9  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  23.11 
 
 		 568 aa  90.9  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  27.74 
 
 		 563 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 571 aa  90.5  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.9 
 
 		 553 aa  90.5  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.77 
 
 		 569 aa  90.9  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>