More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1290 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  100 
 
 		 350 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  94.57 
 
 		 368 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  94.29 
 
 		 368 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  60.06 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  54.41 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  56.18 
 
 		 364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  54.65 
 
 		 355 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  51.56 
 
 		 364 aa  346  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  55.62 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  51.91 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  52.41 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  52.96 
 
 		 359 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  52.72 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  52.44 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  52.66 
 
 		 368 aa  335  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  52.44 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  51.47 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  52.45 
 
 		 387 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  50.88 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  50.15 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  53.1 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  50.88 
 
 		 364 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  47.08 
 
 		 355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  47.34 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  49.27 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.42 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  49.09 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  51.16 
 
 		 361 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  46.76 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  54.6 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  46.47 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  50.15 
 
 		 366 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 366 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  49.13 
 
 		 365 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  47.8 
 
 		 360 aa  298  9e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  48.29 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 363 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  47.76 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 366 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  49.7 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  46.86 
 
 		 362 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  49.42 
 
 		 365 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  49.7 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  47.26 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  49.24 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  45.06 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  47.26 
 
 		 362 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  44.35 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  44.06 
 
 		 360 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  44.67 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  44.31 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  43.9 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  48.14 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  40.11 
 
 		 373 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  42.94 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  38.84 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.79 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  34.26 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 355 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  39.94 
 
 		 352 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  34.4 
 
 		 354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 365 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.36 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  31.75 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 347 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  31.91 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  30.4 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4849  inner-membrane translocator  32.4 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  34.23 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 344 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4234  inner-membrane translocator  30.75 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.76 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  31.3 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  31.49 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 344 aa  155  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 		 365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  28.92 
 
 		 365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.33 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>