More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2465 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
218 aa  411  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  33.49 
 
 
222 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  27.88 
 
 
224 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  31.88 
 
 
219 aa  105  7e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 
238 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  30.62 
 
 
219 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05960  cAMP-binding protein  29.5 
 
 
215 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0213  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.89 
 
 
224 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.2 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  30.56 
 
 
227 aa  94.7  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  25.84 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.1 
 
 
229 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  30.1 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  25.36 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2221  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.181319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.64 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.91 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  26.32 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.36 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.07 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  23 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13660  cAMP-binding protein  21.72 
 
 
249 aa  72  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  20.81 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.37 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.98 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  24.07 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.89 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.32 
 
 
226 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.93 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  18.44 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  18.8 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.87 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 
227 aa  59.7  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.34 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.44 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.49 
 
 
246 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.49 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.77 
 
 
244 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.27 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.09 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.66 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.72 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.27 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.63 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1619  cyclic nucleotide-binding  18.48 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.146026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.53 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.4 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.53 
 
 
226 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  19.18 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.2 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  19.16 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.72 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  17.35 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  19.27 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.73 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.14 
 
 
225 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.96 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.46 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  22.73 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.78 
 
 
243 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  18.1 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
239 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>