More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  75.96 
 
 		 208 aa  329  2e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  76.92 
 
 		 208 aa  324  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  76.1 
 
 		 205 aa  324  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  311  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  66.35 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  67.31 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  67.79 
 
 		 208 aa  288  4e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  67.31 
 
 		 208 aa  285  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  64.9 
 
 		 208 aa  274  8e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  55.61 
 
 		 202 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  58.05 
 
 		 203 aa  231  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  56.28 
 
 		 203 aa  215  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  54.36 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  54.77 
 
 		 203 aa  204  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.55 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  52.31 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 200 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  44.1 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  44.1 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  40.89 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  41.12 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  46.73 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  39.6 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  42.56 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.59 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  39.6 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  42.64 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  38.19 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  42.79 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  39.7 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  45.3 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.22 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  36.68 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  40.4 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  34.85 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  37.25 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  36.68 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  40.76 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  39.39 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  44.2 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  39.51 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  38.73 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  37.84 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  39.78 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  41 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  37.78 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  36.82 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  44.2 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  38.24 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  40.33 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  40.8 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  39.01 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  40.33 
 
 		 208 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  35.32 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  41.79 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  38.5 
 
 		 205 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  37.13 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  38.86 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  38.24 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 202 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  38.6 
 
 		 206 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 203 aa  134  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  38.73 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  40.33 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  40.88 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>