More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3268 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 411 aa  802    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  56.04 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  55.67 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  54.5 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  53.45 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  55.91 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  55.41 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  50.82 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07000  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  57.93 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  52.42 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  55.53 
 
 		 390 aa  388  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  52.27 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  51.87 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  54.24 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  52.96 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  52.14 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  50.12 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  55.01 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  50 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  51.55 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  49.64 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  53.12 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  49.5 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  51.17 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  48.19 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  48.71 
 
 		 393 aa  319  7e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  46.92 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  44.96 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  43.35 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  41.38 
 
 		 396 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  41.77 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  41.77 
 
 		 388 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  41.46 
 
 		 388 aa  262  8e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  41.77 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  45.94 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  42.09 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  42.9 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  36.69 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  35.48 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  35.96 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  35.96 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  36.18 
 
 		 385 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  38.97 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  41.08 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  35.48 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  38.36 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  38.36 
 
 		 385 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  37.74 
 
 		 378 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  31.87 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1648  deacetylase  36.06 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0180748  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75957  predicted protein  32.63 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  36.67 
 
 		 348 aa  169  7e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49800  histone deacetylase 1 isoform  33.54 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119518  histone deacetylase, probable  32.16 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03806  Histone deacetylase HosA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F4]  34.65 
 
 		 482 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175107  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02110  histone deacetylation-related protein, putative  30.06 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.225497  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51026  histone deacetylase 1 isoform  32.23 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02060  histone deacetylase 1-1 (hd1), putative  30.6 
 
 		 659 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300789  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02840  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  33.54 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2534  histone deacetylase family protein  37.43 
 
 		 388 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2162  histone deacetylase superfamily  37.43 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000369065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1882  histone deacetylase superfamily protein  35.98 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.70694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  33.57 
 
 		 360 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  35.92 
 
 		 321 aa  153  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  30.38 
 
 		 487 aa  152  8.999999999999999e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  29.73 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57812  predicted protein  28.49 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  29.38 
 
 		 621 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  35.26 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  32.17 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  32.17 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2054  histone deacetylase family protein  37.85 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  32 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  35.92 
 
 		 406 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81035  histone deacetylase transcription modifier  27.3 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.773072 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  31.49 
 
 		 478 aa  143  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04493  Histone deacetylase RpdAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4F5]  30.4 
 
 		 687 aa  142  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0432727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  31.75 
 
 		 439 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  27.73 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  31.53 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  31.53 
 
 		 438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  31.85 
 
 		 480 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0697  histone deacetylase superfamily protein  37.38 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.22424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2390  putative acetoin utilization protein  41.18 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.569115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  31.27 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  32.08 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  33.98 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1054  histone deacetylase superfamily protein  40.34 
 
 		 369 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.836355  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  31.45 
 
 		 438 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3274  histone deacetylase superfamily protein  35.16 
 
 		 375 aa  136  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  31.97 
 
 		 315 aa  136  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  29.65 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.595114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>