113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2402 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  95.36 
 
 
453 aa  812    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  95.58 
 
 
453 aa  813    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  77.26 
 
 
451 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 
504 aa  1020    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  78.59 
 
 
451 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  75.94 
 
 
451 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  78.59 
 
 
451 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  95.36 
 
 
453 aa  812    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  95.36 
 
 
453 aa  812    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  95.36 
 
 
453 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  95.55 
 
 
449 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  95.36 
 
 
453 aa  812    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  77.92 
 
 
451 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  75.5 
 
 
451 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  61.43 
 
 
401 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  46.03 
 
 
507 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  43.27 
 
 
539 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3209  Chitinase  36.27 
 
 
537 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  43.09 
 
 
1194 aa  232  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  37.09 
 
 
540 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  40.65 
 
 
562 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.302151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03189  periplasmic endochitinase  39.94 
 
 
686 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.407335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0375  Lysozyme  39.94 
 
 
897 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.300851  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3533  bifunctional chitinase/lysozyme  39.94 
 
 
897 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0541888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0375  lysozyme  39.94 
 
 
897 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0820031  normal  0.933049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03140  hypothetical protein  39.94 
 
 
686 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.268345  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  39.94 
 
 
2305 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  36.89 
 
 
393 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  39.93 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  37.74 
 
 
358 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  32.74 
 
 
543 aa  176  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  35.85 
 
 
593 aa  173  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  35.65 
 
 
665 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  35.46 
 
 
481 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  38.78 
 
 
751 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.59 
 
 
2310 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.78 
 
 
623 aa  157  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  33.14 
 
 
324 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  33.81 
 
 
324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.52 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  34.27 
 
 
597 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  32.14 
 
 
421 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  31.32 
 
 
591 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  33.99 
 
 
324 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  29.94 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  33.55 
 
 
315 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  32.54 
 
 
526 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  31.58 
 
 
492 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  29.68 
 
 
552 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  27.6 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  36.15 
 
 
452 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  30.14 
 
 
561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  27.06 
 
 
514 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  31.77 
 
 
465 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  29.14 
 
 
461 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2281  hypothetical protein  30.67 
 
 
361 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.120697  normal  0.125889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2747  cellulose-binding domain-containing protein  30.63 
 
 
671 aa  97.1  6e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6755  hypothetical protein  27.8 
 
 
358 aa  95.1  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.319282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  46.46 
 
 
675 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3717  Carbohydrate-binding family V/XII  30.32 
 
 
436 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.0379459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.13 
 
 
669 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  26.11 
 
 
521 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  38.98 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  39.76 
 
 
985 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6728  glycosyl hydrolase family chitinase  27.98 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.749881  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  39.29 
 
 
868 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  39.29 
 
 
868 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  40.43 
 
 
1577 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  38.1 
 
 
868 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  40.7 
 
 
563 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  35.71 
 
 
869 aa  60.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  32.99 
 
 
1242 aa  60.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3389  Heparinase II/III family protein  35.11 
 
 
1260 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  36.46 
 
 
634 aa  60.5  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  33.65 
 
 
657 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  38.83 
 
 
586 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 
867 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 
868 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  33 
 
 
868 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  34 
 
 
868 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 
863 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  56.1 
 
 
855 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.99 
 
 
1331 aa  55.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  58.14 
 
 
574 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  50.94 
 
 
848 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  36.71 
 
 
353 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  47.06 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  48.89 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  47.17 
 
 
420 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  34.74 
 
 
709 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  50 
 
 
855 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  58.33 
 
 
445 aa  50.1  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1429  carbohydrate-binding family V/XII protein  78.57 
 
 
29 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0994108  hitchhiker  0.000249983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  51.16 
 
 
816 aa  49.3  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  35.44 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  47.73 
 
 
567 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  43.48 
 
 
772 aa  48.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  45 
 
 
639 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.62 
 
 
486 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  55 
 
 
566 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>