More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1156 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  97.93 
 
 		 194 aa  387  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  96.35 
 
 		 193 aa  376  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  96.88 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  95.31 
 
 		 193 aa  373  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  95.83 
 
 		 193 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  93.23 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  92.19 
 
 		 193 aa  361  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2188  transcriptional regulator, TetR family  42.33 
 
 		 194 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.16 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 229 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  34.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  34.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  34.78 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  33.93 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 346 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  27.03 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  34.25 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 240 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 250 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  34.07 
 
 		 233 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 241 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.52 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>