More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1193 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  100 
 
 		 391 aa  791    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  76 
 
 		 371 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  73.31 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  58.04 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1063  signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 		 358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6722  signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.16203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1476  signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0180149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2752  Signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.25637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 453 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  31.25 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 815 aa  136  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1654 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.04 
 
 		 744 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 1239 aa  123  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 2693 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 771 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 1560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 941 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.47 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 732 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 551 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 746 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 767 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.91 
 
 		 1668 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 1663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 832 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 1676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.18 
 
 		 783 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 572 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 872 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 362 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 752 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 526 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 771 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0889  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 475 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0384  two component sensor kinase  35.21 
 
 		 344 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 945 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.71 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  27.52 
 
 		 754 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 3706 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 532 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 834 aa  107  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 1093 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 764 aa  106  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 215 aa  106  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 839 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 613 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5952  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 1093 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 964 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1052  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 991 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 709 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 747 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  26.39 
 
 		 918 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 932 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 1714 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 1177 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 681 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 980 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4164  hypothetical protein  25.07 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 1051 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>