More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4268 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  265  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  70.37 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  69.63 
 
 		 135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  62.22 
 
 		 135 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  58.52 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  54.81 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  48.53 
 
 		 136 aa  127  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  48.89 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  49.26 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  37.4 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  39.71 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  39.71 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.23 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.41 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  27.86 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  25.93 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  27.94 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.94 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  35.85 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  30.23 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  30.6 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.19 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  34.58 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  34.58 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.87 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  29.82 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>