More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3360 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  47.27 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  32.26 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  21.68 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2012  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  51.02 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  43.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1714  regulatory protein, TetR  38.75 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.841461  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  43.55 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  25 
 
 		 145 aa  52  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 388 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>