More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0945 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 496 aa  976    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  33.96 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  33.39 
 
 		 585 aa  256  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  33.66 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  31.98 
 
 		 620 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  37.11 
 
 		 550 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  34.8 
 
 		 584 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  41.24 
 
 		 680 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  33.89 
 
 		 620 aa  240  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  34.5 
 
 		 585 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  40.6 
 
 		 603 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  41.04 
 
 		 674 aa  233  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  35.8 
 
 		 538 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  44.15 
 
 		 607 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  44.85 
 
 		 605 aa  229  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  40.45 
 
 		 564 aa  227  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  39.78 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  32.08 
 
 		 661 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  43.1 
 
 		 599 aa  216  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  43.14 
 
 		 617 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  40.91 
 
 		 656 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  41.26 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  36.3 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  38.3 
 
 		 684 aa  210  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.73 
 
 		 759 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  38.75 
 
 		 670 aa  207  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.2 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  37.84 
 
 		 653 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  31.9 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  38.26 
 
 		 640 aa  202  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  33.66 
 
 		 535 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  37.84 
 
 		 666 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  36.33 
 
 		 714 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  34.17 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  34.84 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  31.47 
 
 		 465 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  31.03 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  32.02 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  34.14 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  32.43 
 
 		 533 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  31.47 
 
 		 530 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  39.94 
 
 		 632 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  33.58 
 
 		 532 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  32.64 
 
 		 532 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  32.35 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  32.35 
 
 		 470 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  30.36 
 
 		 470 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  34.82 
 
 		 740 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  32.66 
 
 		 533 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  42.09 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.17 
 
 		 532 aa  194  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  34.17 
 
 		 534 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  42.09 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  33.5 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  42.09 
 
 		 598 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  31.94 
 
 		 594 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  31.94 
 
 		 594 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.35 
 
 		 853 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  32.91 
 
 		 533 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  32.9 
 
 		 464 aa  193  7e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  32.27 
 
 		 533 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  33.12 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.05 
 
 		 856 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  32.66 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 525 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  30.39 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  32.92 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  33.51 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  30.5 
 
 		 474 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  31.73 
 
 		 487 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  30.93 
 
 		 900 aa  189  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  30.86 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  41.67 
 
 		 573 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  33.92 
 
 		 526 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  32.66 
 
 		 532 aa  186  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.91 
 
 		 856 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  32.37 
 
 		 977 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  30.75 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  33.09 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  30.88 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  33.83 
 
 		 535 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  29.98 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  30.32 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 843 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  32 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  31.05 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  31.41 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  30.87 
 
 		 531 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  37.16 
 
 		 649 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  31.49 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 		 834 aa  177  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  32.2 
 
 		 524 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  31.48 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.65 
 
 		 495 aa  176  8e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  30.23 
 
 		 855 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  32.82 
 
 		 748 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  31.17 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>