More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1906 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  62.53 
 
 
756 aa  712    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  95.19 
 
 
750 aa  1190    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  100 
 
 
750 aa  1415    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  95.47 
 
 
750 aa  1196    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.94 
 
 
748 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 
797 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 
709 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  35.33 
 
 
709 aa  189  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.57 
 
 
747 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  31.62 
 
 
730 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  28.06 
 
 
715 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 
721 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  29.78 
 
 
798 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  27.44 
 
 
719 aa  146  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  29.91 
 
 
698 aa  145  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 
833 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  36.39 
 
 
776 aa  135  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 
774 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  32.96 
 
 
774 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  32.95 
 
 
782 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 
788 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  27.31 
 
 
729 aa  124  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  27.6 
 
 
731 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  37.81 
 
 
760 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
800 aa  118  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 
650 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  31.36 
 
 
643 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  32.62 
 
 
650 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 
777 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  36.71 
 
 
757 aa  114  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  45.57 
 
 
661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  41.94 
 
 
688 aa  113  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 
642 aa  112  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 
640 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  36.59 
 
 
720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.19 
 
 
593 aa  111  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.19 
 
 
593 aa  111  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  41.28 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 
641 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 
650 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.29 
 
 
642 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  26.5 
 
 
730 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 
650 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  41.28 
 
 
641 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.7 
 
 
641 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 
772 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  29.06 
 
 
735 aa  109  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  38.24 
 
 
660 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  32.7 
 
 
808 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  41.29 
 
 
642 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 
657 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
642 aa  108  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  28.83 
 
 
739 aa  107  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  31.1 
 
 
607 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  31.4 
 
 
650 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
641 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  40.65 
 
 
657 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  26.32 
 
 
730 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 
641 aa  107  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 
649 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 
650 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  28.67 
 
 
724 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  44.16 
 
 
187 aa  107  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  31.4 
 
 
650 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 
804 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 
195 aa  106  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.03 
 
 
669 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 
641 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  40.7 
 
 
641 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
650 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  39.51 
 
 
643 aa  105  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  38.75 
 
 
645 aa  105  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.36 
 
 
735 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  40.25 
 
 
643 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  39.49 
 
 
645 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  37.06 
 
 
642 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  37.06 
 
 
642 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 
645 aa  105  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  34.17 
 
 
663 aa  104  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 
641 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  40.97 
 
 
677 aa  104  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.91 
 
 
645 aa  104  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.51 
 
 
603 aa  104  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  42.95 
 
 
651 aa  104  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  42.66 
 
 
649 aa  104  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  29.78 
 
 
706 aa  103  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  30.48 
 
 
726 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  41.83 
 
 
651 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  41.83 
 
 
651 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  41.83 
 
 
651 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>