More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0793 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 		 706 aa  1483    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  33.96 
 
 		 561 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  34.06 
 
 		 608 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 513 aa  270  8e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 487 aa  247  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  32.58 
 
 		 491 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.74 
 
 		 495 aa  228  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 489 aa  227  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 496 aa  223  8e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.74 
 
 		 506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 472 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 512 aa  220  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 		 609 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 573 aa  196  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 578 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 573 aa  191  5e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 559 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 582 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 467 aa  157  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 436 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 441 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  28.47 
 
 		 465 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 		 470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 447 aa  132  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 441 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.4 
 
 		 455 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  28.35 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 543 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 463 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.93 
 
 		 486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 458 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  25.05 
 
 		 776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 727 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 442 aa  111  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.18 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 474 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.65 
 
 		 479 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 523 aa  107  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  26.44 
 
 		 471 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.58 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 		 519 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.51 
 
 		 399 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30 
 
 		 397 aa  87  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.26 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 415 aa  80.5  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  30.05 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 406 aa  73.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 406 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  25.11 
 
 		 391 aa  72  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 		 330 aa  72  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 363 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 396 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.33 
 
 		 479 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 327 aa  69.7  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.93 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.69 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 496 aa  66.6  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 347 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 331 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>