110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1180 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  100 
 
 		 266 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  62.84 
 
 		 286 aa  319  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  60.15 
 
 		 295 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  58.91 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  58.08 
 
 		 299 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  56.98 
 
 		 302 aa  288  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  56.76 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  57.79 
 
 		 320 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  54.96 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  52.65 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  54.23 
 
 		 333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  53.38 
 
 		 267 aa  281  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  56.47 
 
 		 297 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  49.83 
 
 		 313 aa  272  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  52.73 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  53.03 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  53.64 
 
 		 273 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  54.9 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  52.26 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  51.53 
 
 		 280 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  55 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  53.23 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  53.23 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  53.23 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.47 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  52.85 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  52.08 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  52.57 
 
 		 295 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  50.57 
 
 		 278 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  46.88 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  37.94 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 1019 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  32.43 
 
 		 366 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  32.45 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.32 
 
 		 615 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.03 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  31.02 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  28.68 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  24.52 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  28.77 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  20.96 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  28.2 
 
 		 1038 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  29.32 
 
 		 1038 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  24.54 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  28.85 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  23.99 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  28.52 
 
 		 1055 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.88 
 
 		 1016 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  24.51 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  23.93 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  24.61 
 
 		 781 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  28.41 
 
 		 387 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  22.39 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  26.88 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 1052 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  26.07 
 
 		 1059 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  25 
 
 		 1044 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  27.6 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  26.32 
 
 		 783 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.54 
 
 		 988 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  27.95 
 
 		 920 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 1051 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 1051 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 1051 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.46 
 
 		 1051 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1310  hypothetical protein  21.67 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.251322  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.79 
 
 		 1048 aa  49.3  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 1094 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  27.42 
 
 		 1101 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.01 
 
 		 786 aa  48.9  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  36.47 
 
 		 1119 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0781  hypothetical protein  29.87 
 
 		 886 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384751  normal  0.165581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  35.04 
 
 		 1136 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  27.27 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  28.65 
 
 		 1176 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  28.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.59 
 
 		 1124 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 1135 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  28.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  28.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  40.7 
 
 		 1164 aa  46.2  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3983  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1100 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.588967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  30 
 
 		 1349 aa  45.4  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  29.31 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  24.68 
 
 		 1060 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1429  hypothetical protein  19.92 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 1060 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5053  hypothetical protein  24.42 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.609849 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.88 
 
 		 1140 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3877  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1151 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  29.45 
 
 		 993 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  32.77 
 
 		 1091 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.28 
 
 		 1144 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1299  hypothetical protein  20.15 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0504413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  32.09 
 
 		 1054 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4020  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1079 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 1134 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>