More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3171 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3171  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 255 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0188228  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  63.67 
 
 		 250 aa  317  9e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  60.64 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  62.7 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  59.18 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  59.43 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  59.02 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.14 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  54.84 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  54.92 
 
 		 251 aa  254  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  56.1 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  57.38 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  53.66 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4398  ABC transporter related  55.02 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  53.06 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  56.15 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  52.46 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3271  ABC transporter related  55 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  50 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  51.59 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  48.41 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  50.4 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  51 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1332  ABC transporter related  51.6 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  55.73 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  49.39 
 
 		 251 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0084  ABC transporter related  51.23 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  48.58 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  46.22 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2234  ABC transporter related  47.54 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.886454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  48.18 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  50 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2769  ABC transporter related  45.49 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0502459  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  48.35 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3827  ABC transporter related  54.29 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  49.6 
 
 		 250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  49 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4819  ABC transporter related  47.47 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  46.12 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1229  ABC transporter-related protein  49.59 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0988028  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  45.78 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  45.87 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5098  ABC transporter related  51.23 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  51.24 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.24 
 
 		 233 aa  216  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  49.58 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5725  ABC transporter related  45.78 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6089  ABC transporter related  45.78 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.589988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  51.03 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3461  ABC transporter related  47.35 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  44.58 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6572  ABC transporter related  45.78 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25899  normal  0.0683418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  46.69 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  45.08 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  43.37 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.72 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  46.09 
 
 		 250 aa  211  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  46.31 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  47.15 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3804  ABC transporter related  46.56 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  49.17 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  46.75 
 
 		 259 aa  207  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.87 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  46.09 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  45.04 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  47.52 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  47.52 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  45.56 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  44.31 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  44.4 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2174  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  42.4 
 
 		 268 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.62 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  43.09 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4753  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  42.63 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  45.08 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  44.49 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.62 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  44.35 
 
 		 252 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.56 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  47.46 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  49.16 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.22 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  46.25 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4205  ABC transporter related  44.86 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.628741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.2 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  47.39 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  47.68 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  43.44 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>