More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1944 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  100 
 
 		 352 aa  723    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1896  periplasmic binding protein  32.87 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0464  ABC-type transport system, periplasmic component  32.1 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  29.18 
 
 		 315 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.2 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  29.39 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1074  putative iron transporterer, plasmic binding protein  30.8 
 
 		 305 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.738523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1213  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  28.39 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3695  periplasmic binding protein  30.59 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  26.52 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  29.54 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  29.87 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1837  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.67 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  26.4 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  26.4 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  27.6 
 
 		 331 aa  97.8  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  32.52 
 
 		 361 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.66 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.41 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  27.3 
 
 		 305 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  92.8  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1066  periplasmic binding protein  32.3 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.65 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2403  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, periplasmic substrate-binding subunit  32.3 
 
 		 286 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  27.3 
 
 		 305 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1383  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 272 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0803202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  25.4 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.56 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  25.09 
 
 		 335 aa  89.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3106  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compount-binding protein, putative  26.22 
 
 		 312 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  24.92 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1003  periplasmic binding protein  32.21 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0533544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  30 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4383  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.517095  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0259  periplasmic binding protein  30.1 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  0.0661567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3882  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.46 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  28.71 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  27.96 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  25.37 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2313  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2738  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0534009  normal  0.0855423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1827  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1426  iron(III) ABC transporter, iron(III)-binding protein  24.62 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0283487  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1155  periplasmic binding protein  25.91 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0489  periplasmic binding protein  27.55 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.279371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  29.41 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2064  periplasmic binding protein  26.2 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.895958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  26.94 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4687  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0140247  hitchhiker  0.000000000756756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4553  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697431  hitchhiker  0.000000125812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4565  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1305  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.7 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0880  corrinoid ABC transporter substrate-binding protein  27.16 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  26.43 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 682 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.04 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0137  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4239  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2922  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154737  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1367  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4689  periplasmic binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 682 aa  70.5  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1346  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  26.78 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.01 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0345  periplasmic binding protein  28.81 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  23.51 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1388  iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  25.4 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.783574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>