192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1155 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1155  periplasmic binding protein  100 
 
 		 380 aa  752    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1465  periplasmic binding protein  36.45 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.614656  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0807  periplasmic binding protein  31.08 
 
 		 329 aa  123  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.322947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.28 
 
 		 315 aa  97.1  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.6 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 322 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.24 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  28.1 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.55 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.55 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.32 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  27.14 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.74 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  26.09 
 
 		 335 aa  72.8  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4372  periplasmic binding protein  28.06 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.670262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0990  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.42 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.224128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3326  vitamin B12-transporter protein BtuF  23.3 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  25.09 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2939  periplasmic binding protein  30 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0108677  hitchhiker  0.00600632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3455  vitamin B12-transporter protein BtuF  22.97 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  26.39 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  22.34 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  22.76 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0311  periplasmic binding protein  29.78 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  21.95 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3093  periplasmic binding protein  29.31 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712568 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  23.28 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.19 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  22.83 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1322  periplasmic binding protein  23.19 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.689282  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1304  periplasmic binding protein  23.48 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  24.82 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.17 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3565  periplasmic binding protein  24 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  21.6 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  25 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0274  periplasmic binding protein  22.43 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.880805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  25 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1523  periplasmic binding protein  23.47 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.137922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0831  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  30.6 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  21.25 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  25 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  21.89 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0371  periplasmic binding protein  27.5 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  19.64 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1852  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 309 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.416782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  22.85 
 
 		 312 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3846  periplasmic binding protein  20.51 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.907593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  22.56 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3943  periplasmic binding protein  30.86 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  21.41 
 
 		 682 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2759  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.199201  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0573  hemin-binding periplasmic protein hmuT  22.36 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1518  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  22.11 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  20.88 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0995  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2873  periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3205  periplasmic binding protein  24.58 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.954932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2195  periplasmic binding protein  23.13 
 
 		 294 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0123698  normal  0.456206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3164  periplasmic binding protein  23.98 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  20.74 
 
 		 274 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0786  vitamin B12-transporter protein BtuF  20.49 
 
 		 268 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  22.46 
 
 		 304 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  24.19 
 
 		 312 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  22.07 
 
 		 308 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  20.53 
 
 		 300 aa  52.8  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.85 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0726  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.38 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.19297  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  23.76 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>