113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1206 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 1142 aa  2325    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  24.36 
 
 		 1133 aa  105  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 1398 aa  95.1  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 1403 aa  93.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 		 1105 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  22.83 
 
 		 1122 aa  79  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  23.68 
 
 		 1346 aa  78.2  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.06 
 
 		 1134 aa  76.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.25 
 
 		 1053 aa  75.1  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  20.08 
 
 		 1048 aa  75.1  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.39 
 
 		 914 aa  75.1  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.55 
 
 		 1055 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.92 
 
 		 1087 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.89 
 
 		 1020 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 		 1402 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 		 1050 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.62 
 
 		 1050 aa  72.4  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.11 
 
 		 1175 aa  71.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  25.15 
 
 		 1183 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  22.92 
 
 		 1422 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  27.43 
 
 		 1358 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  24.38 
 
 		 1227 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  24.73 
 
 		 900 aa  69.7  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  22.29 
 
 		 1034 aa  65.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.36 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 1118 aa  65.1  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.42 
 
 		 1289 aa  64.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 		 1027 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 		 1027 aa  64.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 		 1027 aa  63.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  22.31 
 
 		 1383 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  24.29 
 
 		 954 aa  62.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 905 aa  62  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  25.54 
 
 		 1029 aa  61.6  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 		 956 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 1340 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  23.83 
 
 		 956 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 1400 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  19.9 
 
 		 1320 aa  60.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.37 
 
 		 1422 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.74 
 
 		 916 aa  58.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  22.46 
 
 		 1046 aa  58.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  22.69 
 
 		 867 aa  58.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  22.39 
 
 		 1067 aa  57.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  22.53 
 
 		 1057 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.55 
 
 		 1429 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  24.92 
 
 		 967 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  22.93 
 
 		 1037 aa  55.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 973 aa  55.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.54 
 
 		 1014 aa  54.7  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  21.7 
 
 		 1148 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.29 
 
 		 1023 aa  54.3  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  18.43 
 
 		 1153 aa  54.3  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 993 aa  53.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  25.8 
 
 		 948 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  23.83 
 
 		 1043 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  23.18 
 
 		 1192 aa  52.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  23.79 
 
 		 1065 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.8 
 
 		 1169 aa  52.4  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  24.89 
 
 		 982 aa  51.6  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 636 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.72 
 
 		 1151 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  24.88 
 
 		 1013 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.99 
 
 		 1141 aa  50.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  23.64 
 
 		 1353 aa  50.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 		 999 aa  50.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 		 965 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  21.88 
 
 		 1139 aa  49.3  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  22.69 
 
 		 1151 aa  49.3  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  23 
 
 		 1126 aa  49.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  23.54 
 
 		 956 aa  49.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  26.25 
 
 		 713 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  23.44 
 
 		 1141 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  23.58 
 
 		 1148 aa  48.9  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  24.55 
 
 		 919 aa  48.5  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 1297 aa  48.5  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.31 
 
 		 1075 aa  47.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  26.34 
 
 		 275 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  25.46 
 
 		 723 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 975 aa  47.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  22.73 
 
 		 1123 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 		 1349 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 		 852 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.99 
 
 		 1468 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  35.29 
 
 		 1190 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.24 
 
 		 2303 aa  46.6  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  22.96 
 
 		 864 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  26.47 
 
 		 953 aa  47.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 998 aa  47.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 1321 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  23.95 
 
 		 1666 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  24.04 
 
 		 970 aa  47  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  23.49 
 
 		 1071 aa  47.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  24.33 
 
 		 960 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.23 
 
 		 1055 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  24.46 
 
 		 959 aa  46.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  24.42 
 
 		 1163 aa  46.2  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  25.91 
 
 		 1054 aa  46.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>