More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003356 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003356  multidrug resistance efflux pump  100 
 
 		 271 aa  550  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000276837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  49.25 
 
 		 355 aa  256  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  46.79 
 
 		 352 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  43.82 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  41.79 
 
 		 351 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 		 380 aa  188  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  39.93 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  39.93 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  40.59 
 
 		 371 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  40 
 
 		 390 aa  185  8e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  39.55 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  40.3 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.24 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 352 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 352 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  41.73 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 352 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 366 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  39.62 
 
 		 363 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  38.87 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  38.81 
 
 		 364 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  42.79 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  38.87 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 349 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  38.49 
 
 		 363 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  42.66 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  39.7 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  42.07 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.04 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  37.88 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  38.52 
 
 		 390 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  38.11 
 
 		 363 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  37.5 
 
 		 344 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 369 aa  165  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 		 354 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  37.31 
 
 		 380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  39.18 
 
 		 375 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  35.58 
 
 		 387 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  42.17 
 
 		 383 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 374 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 460 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 460 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0873  secretion protein HlyD family protein  40.65 
 
 		 353 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  35.21 
 
 		 341 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  42.32 
 
 		 371 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  37.15 
 
 		 372 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  40.81 
 
 		 388 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  41.51 
 
 		 414 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 397 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.33 
 
 		 383 aa  155  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 470 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 475 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  37.69 
 
 		 475 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  37.87 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 358 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27420  putative secretion protein  36.9 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204375  normal  0.853032 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  36 
 
 		 408 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 348 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  35.97 
 
 		 350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  45.41 
 
 		 406 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  36.9 
 
 		 352 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  35.45 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.89 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  37.55 
 
 		 374 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.13 
 
 		 385 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  37.55 
 
 		 374 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  37.55 
 
 		 374 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  39.41 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  35.06 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.48 
 
 		 366 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.32 
 
 		 390 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  38.21 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4576  secretion protein HlyD family protein  40.38 
 
 		 353 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 		 421 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  33.7 
 
 		 386 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  36.15 
 
 		 368 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  32.22 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  39.29 
 
 		 443 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  38.94 
 
 		 360 aa  148  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  38.3 
 
 		 397 aa  148  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  37.31 
 
 		 404 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  36.47 
 
 		 372 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  39.72 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  36.8 
 
 		 396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  35.63 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 400 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  33.83 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  34.88 
 
 		 393 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>