More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3927 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  100 
 
 		 401 aa  782    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  48.36 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  48.36 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  48.11 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  50.38 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  46.1 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  44.75 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  46.32 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  46.09 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  47.37 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  37.53 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.95 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.8 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.16 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  39.69 
 
 		 394 aa  239  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  37.84 
 
 		 392 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  38.93 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.29 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  38.52 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.36 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  39.29 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  38.15 
 
 		 399 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.86 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.01 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  37.05 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.12 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.07 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.25 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.08 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  30.95 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  31.82 
 
 		 383 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.71 
 
 		 432 aa  99.8  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  30.95 
 
 		 523 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.88 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.84 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  29.09 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  29.09 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  32.31 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  32.31 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.92 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.28 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  28.7 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  28.78 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  29.17 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  36.43 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.91 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  30.07 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.99 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.07 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  30.62 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.12 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.48 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  29.48 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  28.1 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.8 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  35.92 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.97 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1578  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.77 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.5845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  30.99 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2184  trypsin-like serine protease  29.44 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  31.62 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  35.04 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  29.66 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.81 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  30.94 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  32.14 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.98 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  29.02 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.05 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.52 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.95 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  29.15 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.52 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  31.15 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  30.57 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.26 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.89 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  29.31 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  30.77 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  28.34 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  32.58 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.17 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  31.69 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.17 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.69 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  32.87 
 
 		 520 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.06 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>