More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1097 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 280 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1069  serine protease, DegP/HtrA family  86.43 
 
 		 282 aa  497  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1286  serine protease  88.89 
 
 		 272 aa  489  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  36.79 
 
 		 394 aa  142  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  38.64 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  35.36 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  38.86 
 
 		 459 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  38.39 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.86 
 
 		 383 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.11 
 
 		 455 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  41.11 
 
 		 466 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  41.11 
 
 		 466 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  32.86 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  32.78 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.52 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  41.99 
 
 		 450 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.78 
 
 		 459 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  38.37 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  41.18 
 
 		 511 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  36.9 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.35 
 
 		 458 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.15 
 
 		 452 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  41.52 
 
 		 463 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  41.52 
 
 		 457 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  42.24 
 
 		 481 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  41.52 
 
 		 457 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  42.24 
 
 		 481 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  42.78 
 
 		 393 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  43.2 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.35 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  43.11 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  37.82 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  42.86 
 
 		 502 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.88 
 
 		 451 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.01 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  41.72 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.45 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.98 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.33 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  39.78 
 
 		 425 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.86 
 
 		 366 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43.54 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42 
 
 		 399 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  43.92 
 
 		 453 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  38.37 
 
 		 451 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  38.3 
 
 		 450 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  37.85 
 
 		 374 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  38.3 
 
 		 450 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  38.3 
 
 		 450 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  38.3 
 
 		 450 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  32.35 
 
 		 476 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  40.94 
 
 		 456 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.44 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.54 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  43.54 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  40.83 
 
 		 496 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  39.77 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  41.25 
 
 		 478 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  40 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  38.22 
 
 		 535 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  40.83 
 
 		 456 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  38.33 
 
 		 417 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  41.38 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  39.46 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  38.73 
 
 		 481 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  40.33 
 
 		 450 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  38.73 
 
 		 481 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.98 
 
 		 440 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  38.05 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.58 
 
 		 375 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 467 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  39.78 
 
 		 474 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.98 
 
 		 440 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.98 
 
 		 440 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  37.79 
 
 		 451 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  40.11 
 
 		 462 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  38.73 
 
 		 481 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.91 
 
 		 453 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  38.6 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.53 
 
 		 471 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  45.14 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  38.8 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  38.8 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  40.12 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  32.77 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.59 
 
 		 485 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  38.05 
 
 		 384 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  47.52 
 
 		 494 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  38.17 
 
 		 476 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  37.77 
 
 		 451 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  36.1 
 
 		 409 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>