More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1069 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1069  serine protease, DegP/HtrA family  100 
 
 		 282 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1286  serine protease  97.06 
 
 		 272 aa  530  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.43 
 
 		 280 aa  497  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  39.48 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  37.63 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  36.9 
 
 		 394 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  43.35 
 
 		 459 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  42.77 
 
 		 442 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.3 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  38.56 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  38.14 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  38.14 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  38.14 
 
 		 383 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  32.92 
 
 		 459 aa  117  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.92 
 
 		 459 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  34.18 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  45.75 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  43.29 
 
 		 511 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  38.03 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  43.71 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 		 377 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.16 
 
 		 466 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  42.16 
 
 		 466 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  45.06 
 
 		 485 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  39.31 
 
 		 452 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.14 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  42.16 
 
 		 455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  42.54 
 
 		 450 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  44.31 
 
 		 476 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  44.38 
 
 		 481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.67 
 
 		 398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  44.38 
 
 		 481 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  38.43 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  42.59 
 
 		 516 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.21 
 
 		 498 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  40.85 
 
 		 491 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.19 
 
 		 515 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  42.07 
 
 		 493 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  43.71 
 
 		 483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.21 
 
 		 450 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  42.69 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  42.54 
 
 		 451 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  43.79 
 
 		 389 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.62 
 
 		 366 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  35.34 
 
 		 476 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  42.17 
 
 		 444 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  34.91 
 
 		 476 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 		 487 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.6 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.04 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  41.46 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  39.01 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2993  protease Do  44.14 
 
 		 476 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.700896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.52 
 
 		 458 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  43.54 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  41.89 
 
 		 535 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.89 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  40.85 
 
 		 490 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  44.14 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.04 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  37.22 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.78 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.33 
 
 		 398 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  42.68 
 
 		 503 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.89 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.42 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.89 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  39.89 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.68 
 
 		 475 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  40.85 
 
 		 476 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  34.78 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.46 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  40.69 
 
 		 467 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03424  protease do  43.12 
 
 		 478 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  39.46 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  42.68 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  40.24 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  37.21 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  40.98 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  40.98 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  33.67 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  40.64 
 
 		 449 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  46.81 
 
 		 494 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.36 
 
 		 450 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  40.72 
 
 		 492 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  40.91 
 
 		 417 aa  106  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  41.99 
 
 		 450 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.36 
 
 		 451 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  45.4 
 
 		 464 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  42.69 
 
 		 463 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  39.13 
 
 		 455 aa  106  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  43.24 
 
 		 453 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  42.69 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  40.35 
 
 		 374 aa  105  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  42.69 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  42.6 
 
 		 456 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  42.69 
 
 		 456 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  42.11 
 
 		 473 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  39.53 
 
 		 350 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>