More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1870 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  100 
 
 		 492 aa  983    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  83.3 
 
 		 491 aa  823    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  98.58 
 
 		 492 aa  971    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  85.53 
 
 		 311 aa  557  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 489 aa  356  5e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  39.41 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 609 aa  293  7e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  34.19 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  34.78 
 
 		 654 aa  286  7e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  34.87 
 
 		 628 aa  279  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 549 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  32.31 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 671 aa  277  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  34.16 
 
 		 545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 556 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.07 
 
 		 591 aa  273  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  34.2 
 
 		 791 aa  272  9e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  34.48 
 
 		 547 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  35.06 
 
 		 682 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  33.4 
 
 		 749 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  34.32 
 
 		 547 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  32.19 
 
 		 797 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  33.83 
 
 		 583 aa  261  3e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  32.97 
 
 		 640 aa  259  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  35.48 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 831 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 847 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 1255 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.27 
 
 		 577 aa  254  3e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  35.71 
 
 		 546 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  36.63 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  35.8 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  41 
 
 		 543 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.73 
 
 		 557 aa  249  9e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  33.26 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  33.12 
 
 		 991 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 1319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  32.24 
 
 		 722 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  34.06 
 
 		 692 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  34.6 
 
 		 1335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 557 aa  243  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  37.2 
 
 		 604 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  34.87 
 
 		 770 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.89 
 
 		 557 aa  240  4e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  32.89 
 
 		 549 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.83 
 
 		 512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  32.71 
 
 		 559 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  36.12 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 612 aa  213  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 515 aa  212  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  33.53 
 
 		 617 aa  208  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  31.83 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 622 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  34.02 
 
 		 620 aa  199  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 472 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  32.27 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  36.21 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.16 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  35.24 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  35.24 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  35.24 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  35.24 
 
 		 523 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  35.24 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  35.24 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  36.78 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.09 
 
 		 466 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  34.52 
 
 		 485 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  30.67 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  34.19 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  33.33 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  34.3 
 
 		 482 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 454 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.58 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  33.98 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  33.56 
 
 		 417 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 460 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 521 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  33.13 
 
 		 491 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  34.52 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  33.55 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>