More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0027 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1070  type II secretion system protein E  95.95 
 
 
494 aa  942  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2151  type II secretion system protein E  88.66 
 
 
494 aa  884  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0031  type II secretion system protein E  90.47 
 
 
494 aa  922  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0027  type II secretion system protein E  100 
 
 
494 aa  1012  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00644516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.21 
 
 
577 aa  175  2e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  31.81 
 
 
510 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.88 
 
 
519 aa  171  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
671 aa  160  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.84 
 
 
572 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  29.04 
 
 
559 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  28.4 
 
 
692 aa  149  1e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
547 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  26.36 
 
 
722 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  27.06 
 
 
473 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.61 
 
 
489 aa  142  1e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  26.53 
 
 
604 aa  142  1e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  31.94 
 
 
1255 aa  142  1e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  26.53 
 
 
556 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
546 aa  139  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  30 
 
 
991 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  29.62 
 
 
513 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
546 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
546 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  26.81 
 
 
549 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  27.8 
 
 
546 aa  136  1e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  25.12 
 
 
609 aa  135  2e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  24.67 
 
 
797 aa  135  2e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  27.43 
 
 
791 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  28.73 
 
 
557 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
847 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  26.05 
 
 
749 aa  134  4e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
492 aa  133  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  27.5 
 
 
831 aa  133  7e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  30.23 
 
 
1319 aa  133  7e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  31.13 
 
 
1335 aa  133  8e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  28.31 
 
 
583 aa  133  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  24.85 
 
 
682 aa  132  1e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  27.94 
 
 
543 aa  132  1e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
551 aa  132  2e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  27.79 
 
 
512 aa  132  2e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
591 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.09 
 
 
483 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
612 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  29.49 
 
 
557 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
492 aa  130  7e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
610 aa  129  1e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.43 
 
 
654 aa  129  1e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  28.11 
 
 
557 aa  127  4e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  27.7 
 
 
557 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  29.23 
 
 
545 aa  126  8e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  28.34 
 
 
515 aa  126  9e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  27.55 
 
 
549 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.97 
 
 
491 aa  126  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.12 
 
 
594 aa  124  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
452 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  31.5 
 
 
634 aa  122  1e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  26.83 
 
 
547 aa  121  4e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  26.56 
 
 
558 aa  120  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  24.57 
 
 
476 aa  120  8e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  30.48 
 
 
444 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  30.48 
 
 
444 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  25.31 
 
 
542 aa  118  2e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
449 aa  119  2e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
639 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.15 
 
 
563 aa  118  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  25.24 
 
 
617 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  26.91 
 
 
628 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30.31 
 
 
450 aa  116  9e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
454 aa  115  1e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  27.3 
 
 
618 aa  116  1e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  26.35 
 
 
770 aa  115  2e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  31.8 
 
 
412 aa  115  2e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
460 aa  115  2e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.53 
 
 
472 aa  115  2e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  28.69 
 
 
572 aa  115  2e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  32.69 
 
 
449 aa  115  2e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  28.72 
 
 
638 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  29.11 
 
 
474 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  28.57 
 
 
463 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  30.65 
 
 
455 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  31.6 
 
 
430 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  25.86 
 
 
640 aa  113  7e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  30.67 
 
 
447 aa  113  7e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  2.24608e-07 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
549 aa  113  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
417 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0126  type II secretion system protein E  30.25 
 
 
737 aa  112  1e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721545  normal  0.429419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  37.44 
 
 
311 aa  112  1e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.45 
 
 
444 aa  113  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  26.25 
 
 
620 aa  112  1e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  30.34 
 
 
446 aa  112  2e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
469 aa  112  2e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  27.65 
 
 
462 aa  112  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  28.33 
 
 
449 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  30.52 
 
 
624 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  30.79 
 
 
469 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  28.29 
 
 
560 aa  111  4e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
450 aa  110  4e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  33.22 
 
 
387 aa  111  4e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  5.91318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  30.13 
 
 
438 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  31.77 
 
 
569 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>