More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2151 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0027  type II secretion system protein E  88.66 
 
 
494 aa  883    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00644516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0031  type II secretion system protein E  89.66 
 
 
494 aa  912    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1070  type II secretion system protein E  88.87 
 
 
494 aa  883    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2151  type II secretion system protein E  100 
 
 
494 aa  1009    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.7 
 
 
577 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  30.41 
 
 
519 aa  176  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
671 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  30.53 
 
 
510 aa  161  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  33.42 
 
 
572 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  28.6 
 
 
559 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  30.18 
 
 
692 aa  153  5e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  27.92 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  27.07 
 
 
473 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  29.13 
 
 
991 aa  144  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.95 
 
 
513 aa  144  5e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  26.83 
 
 
604 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  32.53 
 
 
1255 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  28.17 
 
 
831 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  25.95 
 
 
609 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  28.39 
 
 
610 aa  138  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  27.66 
 
 
546 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  27.15 
 
 
797 aa  137  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  26.96 
 
 
546 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
483 aa  136  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  26.75 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  31.07 
 
 
847 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  26.55 
 
 
749 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  25.86 
 
 
682 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  30.45 
 
 
1319 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  27.75 
 
 
1335 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  26.62 
 
 
557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  27.29 
 
 
549 aa  134  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  28.03 
 
 
549 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  27.02 
 
 
556 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  24.9 
 
 
791 aa  133  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  28.27 
 
 
546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  28.27 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
591 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  30.15 
 
 
545 aa  131  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
612 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
551 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  27 
 
 
557 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  27.83 
 
 
722 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  27.51 
 
 
557 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  26.75 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  27.74 
 
 
543 aa  128  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  26.54 
 
 
617 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  27.36 
 
 
476 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.67 
 
 
492 aa  127  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  28 
 
 
583 aa  127  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
492 aa  125  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  30.56 
 
 
491 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  26.23 
 
 
558 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  25.94 
 
 
618 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  26.43 
 
 
547 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  28.97 
 
 
515 aa  121  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  26.16 
 
 
549 aa  121  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  27.38 
 
 
620 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.18 
 
 
654 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  30.87 
 
 
452 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  29.74 
 
 
634 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.81 
 
 
472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.97 
 
 
594 aa  117  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  27.61 
 
 
628 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.35 
 
 
408 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  30.24 
 
 
450 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  25.37 
 
 
640 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0126  type II secretion system protein E  30.35 
 
 
737 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721545  normal  0.429419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  27.81 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  30.65 
 
 
563 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  32.3 
 
 
469 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  31.38 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  25.44 
 
 
622 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.49 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  30.06 
 
 
444 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  30.06 
 
 
444 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1756  type II secretion system protein E  30.84 
 
 
430 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154  normal  0.161423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
624 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.44 
 
 
449 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  26.07 
 
 
770 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.93 
 
 
311 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  28.32 
 
 
638 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
444 aa  110  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  27.84 
 
 
572 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  30.46 
 
 
454 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
455 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  30.33 
 
 
447 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.53 
 
 
479 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.96 
 
 
447 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  28.54 
 
 
560 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  29.73 
 
 
446 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  30.5 
 
 
438 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  27.51 
 
 
449 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  30.34 
 
 
440 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  28.39 
 
 
463 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.97 
 
 
440 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  28.39 
 
 
492 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>