More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2723 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 208 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 189 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 201 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 211 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 201 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 205 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 198 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 207 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 200 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.91 
 
 		 224 aa  72  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29.44 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>