More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1911 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  66.6 
 
 
944 aa  1261  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.45 
 
 
947 aa  1196  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.25 
 
 
826 aa  674  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  67.44 
 
 
948 aa  1288  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  67.86 
 
 
948 aa  1296  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  66.17 
 
 
944 aa  1256  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.68 
 
 
1075 aa  708  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  66.46 
 
 
944 aa  1272  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.86 
 
 
942 aa  1266  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.11243e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  67.06 
 
 
948 aa  1279  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  70.64 
 
 
945 aa  1357  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.81 
 
 
944 aa  1263  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  49.54 
 
 
780 aa  696  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.38 
 
 
955 aa  1169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
940 aa  1905  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  9.62851e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  50.39 
 
 
780 aa  697  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  66.17 
 
 
944 aa  1250  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  67.12 
 
 
948 aa  1290  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  43.17 
 
 
1310 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.5 
 
 
818 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.01 
 
 
848 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 
818 aa  540  1e-152  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  43.61 
 
 
1503 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  41.73 
 
 
1346 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.97 
 
 
1052 aa  449  1e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 
2346 aa  439  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 
1641 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.16 
 
 
1148 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.5 
 
 
1148 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.73 
 
 
1641 aa  418  1e-115  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45 
 
 
601 aa  406  1e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.88 
 
 
942 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.26 
 
 
641 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.86 
 
 
624 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.95 
 
 
604 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 
604 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 
604 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.69 
 
 
653 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 
603 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.95 
 
 
604 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 
599 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  43.2 
 
 
622 aa  369  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.21 
 
 
620 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.02 
 
 
600 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.08 
 
 
621 aa  365  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.04 
 
 
620 aa  364  5e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.87 
 
 
871 aa  363  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  46.83 
 
 
514 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 
627 aa  359  2e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.42 
 
 
1266 aa  358  3e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.12 
 
 
604 aa  358  3e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.26 
 
 
870 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.26 
 
 
870 aa  357  9e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.12 
 
 
604 aa  356  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 
870 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
870 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
870 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
870 aa  355  3e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.9 
 
 
870 aa  354  5e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.95 
 
 
586 aa  351  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  33.1 
 
 
865 aa  350  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 
873 aa  350  8e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  33.29 
 
 
871 aa  349  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  40 
 
 
795 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.78 
 
 
1284 aa  347  6e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.66 
 
 
870 aa  347  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
876 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  33.1 
 
 
982 aa  344  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.45 
 
 
573 aa  335  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  33.87 
 
 
984 aa  329  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.15 
 
 
885 aa  329  2e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  34.16 
 
 
863 aa  327  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  31.91 
 
 
890 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 
892 aa  320  8e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 
894 aa  319  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  5.84422e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  32.72 
 
 
869 aa  318  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.39 
 
 
1123 aa  286  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 
1010 aa  286  1e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.65 
 
 
2667 aa  285  2e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.85 
 
 
2796 aa  279  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  37.09 
 
 
2775 aa  267  6e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  37.7 
 
 
945 aa  258  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.52 
 
 
868 aa  256  2e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  35.91 
 
 
572 aa  252  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
570 aa  248  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.93 
 
 
1577 aa  248  5e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  31.72 
 
 
1652 aa  247  7e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.42 
 
 
481 aa  247  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  33.41 
 
 
1577 aa  243  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.84 
 
 
575 aa  242  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.12 
 
 
554 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  34.08 
 
 
1591 aa  236  1e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  31.99 
 
 
902 aa  233  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
929 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  61.93 
 
 
713 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>