More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2133 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  100 
 
 		 439 aa  893    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  58.37 
 
 		 454 aa  542  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  59.95 
 
 		 461 aa  535  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  59.41 
 
 		 451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  53.55 
 
 		 443 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  52.4 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  52.16 
 
 		 436 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  50 
 
 		 435 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  50.94 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  50.46 
 
 		 435 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  51.79 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  50 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  49.29 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  50 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  49.53 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  50.89 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  48.54 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  49.76 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  47.2 
 
 		 450 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  48.33 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  51.06 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  50.59 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  50.59 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  48.82 
 
 		 450 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  47.78 
 
 		 441 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  48.22 
 
 		 462 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  46.77 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  49.45 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.95 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  48.23 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.39 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.54 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.39 
 
 		 446 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  45.75 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  44.39 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.08 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  41.41 
 
 		 469 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  42.64 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  42.62 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  38.79 
 
 		 450 aa  299  7e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  34.99 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.8 
 
 		 426 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.26 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  32.04 
 
 		 429 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.17 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.17 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.08 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  31.75 
 
 		 421 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.78 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  31.45 
 
 		 425 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  33.86 
 
 		 427 aa  216  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  32.86 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  33.11 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  35.17 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  30.79 
 
 		 424 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  31.11 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.57 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  31.76 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.47 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.73 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  32.29 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  33.02 
 
 		 425 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  32.64 
 
 		 432 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 431 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  33.8 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.22 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 431 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.85 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  32.3 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.51 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  32.15 
 
 		 431 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.39 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  34.04 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.07 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  30.65 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  31.52 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.77 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  31.29 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  31.29 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  31.29 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.29 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  31.26 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.12 
 
 		 450 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  32.8 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 451 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  30.61 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  30.97 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>