More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1200 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
1864 aa  3689  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  34.7 
 
 
1884 aa  177  2e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.31 
 
 
2911 aa  160  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.23 
 
 
2678 aa  139  7e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.65 
 
 
1079 aa  132  5e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  31.23 
 
 
745 aa  130  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.79 
 
 
1279 aa  130  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  28.67 
 
 
1424 aa  130  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.22 
 
 
2775 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 
2836 aa  123  4e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.7 
 
 
1363 aa  122  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  28.86 
 
 
3954 aa  122  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.41 
 
 
1544 aa  122  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.72 
 
 
4334 aa  120  2e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  27.42 
 
 
4800 aa  118  9e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  29.1 
 
 
556 aa  117  2e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  30.18 
 
 
2954 aa  115  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.14 
 
 
1895 aa  113  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  28.92 
 
 
1400 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  26.71 
 
 
946 aa  112  7e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  28.14 
 
 
1532 aa  110  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  27.15 
 
 
1534 aa  107  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  26.76 
 
 
1286 aa  106  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 
1795 aa  105  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.2 
 
 
2097 aa  105  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.58 
 
 
2667 aa  105  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  30.02 
 
 
795 aa  103  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  28.29 
 
 
1072 aa  102  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.12 
 
 
3427 aa  101  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.75 
 
 
1164 aa  100  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.09 
 
 
3209 aa  100  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.87 
 
 
1180 aa  99.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  32.38 
 
 
1112 aa  99.8  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  26.74 
 
 
1582 aa  98.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.15 
 
 
9867 aa  97.8  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.4 
 
 
1145 aa  97.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  29.28 
 
 
1112 aa  97.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.92 
 
 
2689 aa  96.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.99 
 
 
595 aa  95.9  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.74 
 
 
965 aa  95.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.38 
 
 
2950 aa  95.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  30.2 
 
 
860 aa  95.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.31 
 
 
820 aa  94.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  27.86 
 
 
3619 aa  93.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.6 
 
 
2807 aa  94  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.9 
 
 
3026 aa  91.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.94 
 
 
1415 aa  92  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  28.79 
 
 
2133 aa  90.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.11 
 
 
1019 aa  90.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.02 
 
 
1197 aa  89.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  29 
 
 
574 aa  89.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.2 
 
 
648 aa  88.6  1e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
2105 aa  88.2  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  31.64 
 
 
833 aa  87.8  2e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.33 
 
 
855 aa  87  3e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.76 
 
 
4723 aa  87  3e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  30.26 
 
 
2198 aa  86.7  5e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 
759 aa  85.9  7e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.57 
 
 
813 aa  85.1  1e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.49 
 
 
4687 aa  84.7  1e-14  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  28.61 
 
 
1421 aa  84  2e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  27.74 
 
 
14829 aa  84.3  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  30.25 
 
 
1480 aa  83.6  3e-14  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  28.94 
 
 
3608 aa  83.6  3e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  30 
 
 
959 aa  83.6  3e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.82 
 
 
1963 aa  83.2  4e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.03 
 
 
1236 aa  83.2  4e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.79 
 
 
2467 aa  82.8  5e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0082  type I secretion target repeat-containing protein  33.47 
 
 
355 aa  81.6  1e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.1 
 
 
824 aa  81.3  2e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
475 aa  80.9  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.57 
 
 
1029 aa  80.9  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  40.85 
 
 
1971 aa  80.9  2e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  32.57 
 
 
1029 aa  80.5  3e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  27.44 
 
 
437 aa  80.5  3e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  27.41 
 
 
1156 aa  80.5  3e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  34.48 
 
 
686 aa  80.1  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  29.63 
 
 
460 aa  80.1  4e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 
329 aa  80.1  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.84 
 
 
3598 aa  79.7  4e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.75 
 
 
1499 aa  80.1  4e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  34.05 
 
 
329 aa  80.1  4e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  26.8 
 
 
15831 aa  79.7  5e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  28.43 
 
 
613 aa  79.3  6e-13  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  25.49 
 
 
1383 aa  79.7  6e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  29.75 
 
 
526 aa  79  8e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  27.66 
 
 
850 aa  79  9e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.67 
 
 
2668 aa  79  9e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  33 
 
 
727 aa  78.6  1e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  31.07 
 
 
475 aa  78.6  1e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.83 
 
 
833 aa  77  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  26.69 
 
 
2107 aa  77.4  3e-12  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  33.13 
 
 
2887 aa  77  3e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.57 
 
 
709 aa  76.6  4e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  31.28 
 
 
767 aa  76.6  4e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 
1287 aa  76.6  5e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  33.47 
 
 
2145 aa  76.3  5e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  29.28 
 
 
491 aa  76.3  5e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 
387 aa  76.3  6e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  25.62 
 
 
764 aa  75.9  7e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>