More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3085 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  100 
 
 		 323 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  87.27 
 
 		 323 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  86.65 
 
 		 323 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  86.65 
 
 		 323 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  86.65 
 
 		 323 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  83.28 
 
 		 323 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  81.93 
 
 		 323 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  79.75 
 
 		 322 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  78.68 
 
 		 324 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  57.37 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  52.83 
 
 		 319 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  53.14 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  49.05 
 
 		 320 aa  325  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  48.12 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  47.94 
 
 		 316 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  50.15 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.69 
 
 		 321 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.94 
 
 		 323 aa  298  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  45.22 
 
 		 314 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  41.59 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.12 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.12 
 
 		 348 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0181  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.82 
 
 		 737 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2011  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.34 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0323841  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.57 
 
 		 367 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  37.31 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  35.05 
 
 		 341 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.23 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  36.25 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.7 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  34.83 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  35.81 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  34.23 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.87 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  38.87 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  34.74 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  35.03 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.53 
 
 		 681 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  32.1 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  37.36 
 
 		 595 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.67 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  44.26 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  48.1 
 
 		 794 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  48.1 
 
 		 542 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.34 
 
 		 624 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  48.59 
 
 		 694 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.47 
 
 		 680 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  44.16 
 
 		 431 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  44.81 
 
 		 441 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.02 
 
 		 1550 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  45.57 
 
 		 780 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3728  diguanylate cyclase  28.88 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.183496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  46.45 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  36.68 
 
 		 669 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 		 878 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4543  GAF domain/GGDEF domain/EAL domain protein  36.44 
 
 		 607 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38768  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  30.71 
 
 		 594 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1520  GGDEF domain-containing protein  36.59 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.7 
 
 		 640 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.99 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2220  diguanylate cyclase  27.88 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  44.08 
 
 		 240 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.81 
 
 		 1965 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4330  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.87 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  39.88 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  33.62 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3776  hypothetical protein  35.82 
 
 		 347 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306006 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.9 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2343  putative GAF sensor protein  45.51 
 
 		 165 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 		 514 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 1309 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2664  cyclic diguanylate phosphodiesterase/diguanylate cyclase  32.27 
 
 		 600 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4221  EAL:GAF  35.32 
 
 		 607 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.56 
 
 		 743 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  40.96 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  42.86 
 
 		 743 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.1 
 
 		 781 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 267 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1125 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.95 
 
 		 728 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  45.57 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  39.53 
 
 		 249 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  45.71 
 
 		 497 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  40.12 
 
 		 238 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 		 471 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  41.48 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  41.48 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  41.33 
 
 		 1125 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  41.29 
 
 		 732 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  30.5 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  41.25 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0006  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.42 
 
 		 557 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  41.56 
 
 		 1428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  38.95 
 
 		 249 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  48.3 
 
 		 603 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  38.95 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 890 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>