More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1260 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.23 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  43.28 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  37.96 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.35 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.65 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.65 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.01 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.78 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  47.37 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  28.66 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  40.3 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>