More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0075 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 751 aa  1519    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  62.53 
 
 		 758 aa  974    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  38.99 
 
 		 755 aa  532  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  33.68 
 
 		 742 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 764 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  31.27 
 
 		 723 aa  328  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 726 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 		 849 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 726 aa  325  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  31.81 
 
 		 746 aa  325  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  30.91 
 
 		 732 aa  324  3e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 732 aa  324  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  31.12 
 
 		 726 aa  323  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 		 745 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  29.91 
 
 		 723 aa  313  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 745 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  28.8 
 
 		 745 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  30.52 
 
 		 733 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  31.01 
 
 		 813 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.38 
 
 		 816 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 839 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 738 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 808 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  30.76 
 
 		 817 aa  277  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 808 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  30.79 
 
 		 812 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 		 843 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 698 aa  251  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 709 aa  237  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 725 aa  230  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 725 aa  230  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 725 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 725 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 723 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 723 aa  224  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 723 aa  224  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 701 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 701 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 700 aa  196  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  25.35 
 
 		 713 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 717 aa  190  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  26.62 
 
 		 714 aa  190  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 710 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 721 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  25.99 
 
 		 704 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.59 
 
 		 721 aa  173  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 716 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 783 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.96 
 
 		 724 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  24.5 
 
 		 713 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 739 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 716 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 728 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  24.66 
 
 		 771 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.25 
 
 		 817 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  32.09 
 
 		 332 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 753 aa  115  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.12 
 
 		 750 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4379  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  23.1 
 
 		 861 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.99 
 
 		 862 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 736 aa  79  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  26.77 
 
 		 859 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62350  putative haem/haemoglobin uptake outer membrane receptor PhuR precursor  22.43 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5426  outer membrane hemin receptor  22.3 
 
 		 764 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2030  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 668 aa  75.1  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  24.4 
 
 		 675 aa  74.3  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3661  hypothetical protein  28.85 
 
 		 702 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.71 
 
 		 759 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.81 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 675 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1005  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.81 
 
 		 862 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  26.45 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  21.22 
 
 		 857 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 650 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 700 aa  68.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  20.31 
 
 		 698 aa  68.2  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0203  TonB-dependent receptor, plug  32.85 
 
 		 700 aa  67.8  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.583502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43650  hypothetical protein  28.44 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00638923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4555  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 734 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000444386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 737 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 701 aa  66.2  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6535  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 694 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.822423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0519  heme transport protein HutA  23.05 
 
 		 698 aa  66.6  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 		 679 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.48 
 
 		 680 aa  65.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2172  TonB-dependent receptor, plug  31.85 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2818  TonB-dependent receptor, plug  31.82 
 
 		 691 aa  65.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.54 
 
 		 848 aa  65.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  33.73 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>