More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2542 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  52.66 
 
 		 673 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 704 aa  1451    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.94 
 
 		 670 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.39 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  35.57 
 
 		 694 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  40.4 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 537 aa  361  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 525 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  37.03 
 
 		 510 aa  325  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.06 
 
 		 620 aa  258  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 		 630 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34 
 
 		 641 aa  254  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 		 658 aa  243  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.78 
 
 		 631 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.12 
 
 		 640 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.68 
 
 		 638 aa  224  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.45 
 
 		 631 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.92 
 
 		 673 aa  204  7e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.38 
 
 		 656 aa  185  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.25 
 
 		 671 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  28.33 
 
 		 509 aa  173  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 679 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.46 
 
 		 648 aa  171  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.06 
 
 		 645 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.12 
 
 		 519 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.73 
 
 		 712 aa  153  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 		 668 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  35.91 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.51 
 
 		 665 aa  147  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.38 
 
 		 903 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.93 
 
 		 650 aa  140  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.28 
 
 		 626 aa  140  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 412 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.62 
 
 		 660 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 		 677 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.11 
 
 		 1313 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  25.3 
 
 		 648 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  26.54 
 
 		 653 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  44.36 
 
 		 424 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.72 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  25.28 
 
 		 656 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.09 
 
 		 710 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.6 
 
 		 642 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  46.02 
 
 		 306 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  24.81 
 
 		 672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.3 
 
 		 630 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  25.06 
 
 		 666 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  35.17 
 
 		 505 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  48.18 
 
 		 380 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 464 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 		 241 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 586 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 320 aa  97.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 440 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 360 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  39.52 
 
 		 311 aa  94.7  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 		 712 aa  94.4  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 456 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.77 
 
 		 261 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.77 
 
 		 261 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  32.11 
 
 		 300 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  46.59 
 
 		 1026 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  26.4 
 
 		 613 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 316 aa  90.9  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.55 
 
 		 209 aa  90.5  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 543 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.11 
 
 		 261 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  27.4 
 
 		 734 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.34 
 
 		 331 aa  89.7  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 544 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  42.71 
 
 		 399 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.61 
 
 		 542 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 296 aa  89.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.53 
 
 		 230 aa  88.2  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 316 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 417 aa  87.8  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 		 316 aa  87.4  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40 
 
 		 320 aa  87.4  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 623 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  36.84 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 		 231 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.3 
 
 		 320 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.51 
 
 		 533 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 		 316 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  37.1 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  38.33 
 
 		 369 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  37.1 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  37.1 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  37.1 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  37.1 
 
 		 310 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  34.81 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  37.1 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  32.06 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  37.1 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>