254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4446 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  100 
 
 
209 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  43.87 
 
 
213 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  37.38 
 
 
214 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  38.28 
 
 
205 aa  142  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  37.18 
 
 
263 aa  133  2e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  35.34 
 
 
233 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  34.93 
 
 
233 aa  124  8e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  34.5 
 
 
233 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  36.44 
 
 
243 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46435e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  36.09 
 
 
229 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  9.53974e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  34.1 
 
 
231 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  35.68 
 
 
240 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.16 
 
 
229 aa  116  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.8003e-08  unclonable  8.89639e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  34.35 
 
 
240 aa  115  4e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.17 
 
 
229 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.19805e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  31.18 
 
 
259 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  29.91 
 
 
237 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.32202e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  29.49 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  33.19 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  29 
 
 
264 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  29 
 
 
264 aa  92  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  43.38 
 
 
272 aa  91.7  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  30.36 
 
 
244 aa  91.3  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  29.15 
 
 
244 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  28.22 
 
 
241 aa  84.3  1e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  29.36 
 
 
243 aa  84.7  1e-15  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  28.51 
 
 
225 aa  80.9  1e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  25.86 
 
 
256 aa  79.7  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  33.5 
 
 
248 aa  79.7  3e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  1.929e-10 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  25.43 
 
 
256 aa  77.8  1e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.39 
 
 
225 aa  77.8  1e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  36.23 
 
 
270 aa  77.8  1e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 
210 aa  75.1  7e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  28.72 
 
 
218 aa  73.9  1e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  3.01408e-06 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  26.06 
 
 
215 aa  73.9  2e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  36.09 
 
 
248 aa  72.8  4e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.83 
 
 
230 aa  70.9  1e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  25.76 
 
 
235 aa  70.5  2e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  24.78 
 
 
243 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  26.57 
 
 
210 aa  66.2  3e-10  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  9.33135e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  23.28 
 
 
246 aa  65.5  6e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  49.25 
 
 
131 aa  65.1  7e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.18001e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  29.1 
 
 
219 aa  64.7  8e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  31.61 
 
 
235 aa  64.7  1e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  25.11 
 
 
243 aa  63.5  2e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  30.46 
 
 
230 aa  63.5  2e-09  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.61 
 
 
245 aa  63.5  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.34402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.61 
 
 
245 aa  63.5  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28.35 
 
 
249 aa  62  5e-09  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  27.07 
 
 
244 aa  61.2  1e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  26.25 
 
 
270 aa  60.1  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  6.04594e-05 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  26.36 
 
 
236 aa  60.8  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.24176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.83 
 
 
193 aa  58.9  5e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  28.36 
 
 
216 aa  58.9  6e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  24.29 
 
 
219 aa  58.5  8e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  23.74 
 
 
248 aa  58.5  8e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  21.94 
 
 
238 aa  58.2  9e-08  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  26.51 
 
 
205 aa  57.8  1e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  26.39 
 
 
229 aa  57.8  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  20.57 
 
 
247 aa  56.6  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.16 
 
 
227 aa  57  2e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0569  phage repressor protein, putative  26.03 
 
 
244 aa  57  2e-07  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.251206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.11 
 
 
248 aa  56.2  3e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  2.11881e-06 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  25.93 
 
 
222 aa  56.2  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  7.99679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
133 aa  55.8  4e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0316  putative phage repressor protein  25.57 
 
 
244 aa  55.8  4e-07  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00907838  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  24.24 
 
 
196 aa  55.1  7e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  30.97 
 
 
222 aa  54.7  1e-06  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.98 
 
 
240 aa  54.7  1e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  26.39 
 
 
227 aa  53.9  1e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1124  putative phage repressor protein  25.71 
 
 
239 aa  54.3  1e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000298454  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 
133 aa  53.1  3e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  25.85 
 
 
233 aa  53.1  3e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  30 
 
 
252 aa  52.4  4e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  35.37 
 
 
135 aa  52.4  5e-06  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0763  transcriptional regulator  38.71 
 
 
130 aa  52.4  5e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.305784 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  35.37 
 
 
135 aa  52.4  5e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  37.84 
 
 
144 aa  52  6e-06  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  26.77 
 
 
244 aa  51.6  7e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.08 
 
 
204 aa  52  7e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  25.79 
 
 
216 aa  51.6  8e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  25.79 
 
 
216 aa  51.6  8e-06  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  23.27 
 
 
200 aa  50.8  1e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0413  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 
132 aa  51.2  1e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 
135 aa  50.8  1e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  25.98 
 
 
270 aa  50.8  1e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  38.81 
 
 
135 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
139 aa  50.8  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  9.25763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  25.89 
 
 
251 aa  51.2  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  38.81 
 
 
135 aa  50.8  1e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 
262 aa  50.4  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  40.32 
 
 
262 aa  50.4  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  24.11 
 
 
236 aa  50.8  2e-05  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.05761e-12 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
128 aa  50.4  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  22.73 
 
 
239 aa  50.4  2e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  34.88 
 
 
262 aa  50.4  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 
163 aa  50.4  2e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.70328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
262 aa  50.4  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  24.23 
 
 
204 aa  50.4  2e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  41.79 
 
 
348 aa  50.1  3e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>