More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0887 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  821    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  37.35 
 
 		 444 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 430 aa  235  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 461 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  33.66 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 468 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  32.9 
 
 		 465 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 465 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.33 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.33 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.1 
 
 		 440 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 467 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  36.4 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 438 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  31.49 
 
 		 424 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 433 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 454 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 506 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 443 aa  143  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 441 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 461 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.76 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 578 aa  113  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.72 
 
 		 448 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  28.32 
 
 		 471 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  30.6 
 
 		 479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  33.22 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.18 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  39.62 
 
 		 198 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.79 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 439 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>